这场战役的围攻一方是亚齐人、柔佛为主的马来人军队，人数从一开始的三万一直增加到一个月后的十万。另一方是防守马六甲周围地区的中华军及华人民兵武装，少数生活在马六甲的葡萄牙人、倭人，总数在围城期间一直没超过6000人-7000人，一直坚守到南洋舰队主力从印度洋锡兰岛和爪哇岛赶回。
在战役第一天的晚上，亚齐人攻击了三宝山，毁坏了不少华人墓地。一整夜，中华军及华人武装，包括一些葡萄牙人、倭人雇佣兵都在和亚齐人巷战。第二天早晨，在半个马六甲城陷入敌手的时刻，赵宣明的一个团及时赶到。
前一夜晚上，赵宣明部队坐着十余艘双桅大福船，由三艘纵帆战舰护航来到马六甲海峡东南出口。
在这海峡最狭窄的出口，有淡马锡（明朝把新加坡称作“淡马锡”，即爪哇语Temasek）岛。该岛上早先有14世纪室利佛逝王子拜里米苏兰建立马六甲苏丹王朝时的港口，在上一次南洋大战中被葡萄牙人焚毁了河口的据点。此后，中华军忽略了这个长满红树林、遍布沼泽的岛屿。尹峰忙于应付明朝辽东问题，也忘了新加坡岛的重要性。
淡马锡岛在这几年内只有归属马六甲镇守府管辖的几个马来人村寨存在，另有一处本地华人移民的甘蔗园。中华军则只有一个守备哨队驻防在河口小碉堡内，总兵力不足百人，都是些本地华人移民子弟。赵宣明所部是在接到尹峰命令后来支援马六甲要塞的。此时由于辽东战后中华军各部还在整顿中，南洋舰队北上分遣队还在海南岛等着换装新式青铜拉发大炮，来不及南下。因此，在听闻婆罗洲、爪哇岛、巨港等地掀起暴乱后，尹峰首先想到的是新成立的第六师。
赵宣明是中华军有名的防卫守城专家，现在终于成为了上校师长。他得令后立刻就带着南洋旅旧部组成的第六师第一团出发。
这一天到了淡马锡河口，天色已经黑了。船队中眼力最好的的水手已经在桅杆顶上看到了马六甲方向的火光，隐约还有阵阵炮声传来。马六甲战争初起，岛上的一哨中华军此刻还没搞清发生了什么事。赵宣明部队的尖兵直接冲入防卫松懈的淡马锡河口碉堡，碉堡守备一名哨长居然不在堡内，下面的士兵也毫无战斗准备。他们白天全都没看到马六甲方向的报警烟花，听到隐隐的炮声，却以为是要塞守军在实弹演习。
突然一群黑衣士兵冲入了半掩着的碉堡大门，门口十余名在一齐聊天的守备队士兵惊醒过来，却已被对方用火枪刺刀和匕首一一制住，被下了武器无法动弹。赵宣明和自己的师部直属卫队士兵随后快步进入堡垒，那些士兵面面相觑，有人在火把光下看见了赵宣明的头盔徽记和肩章，颤抖着声音说道：“这位上、上、上校，这是何故？我们是中华军马六甲要塞守备团直属第十二哨队的士兵，自己人啊！”
赵宣明为人低调，中华军中认识他的人不多。他看着说话者冷冷一笑：“你们哨长呢？为何入夜后不关闭堡门？为何不在堡垒前方设立警戒哨位？”
那人张口结舌，半天才说：“……曾哨长在西南面土人的村寨中做客，尚未回堡，我们开着门是，是在等他……”
赵宣明鼻子“哼”了一下，挥挥手叫自己的亲卫队长：“你让这个士兵去把守备队哨长找回来，同时全碉堡进入战时状态，让后队的弟兄待在船上别下来了，告诉护航舰队的海提督，让他立刻派船去马六甲打探情况……”
赵宣明卫队立刻接管了淡马锡河口碉堡的防务。多亏了亚齐人也忽略了此地紧要地形，在攻打马六甲时没有向这里派兵。这个碉堡的守备指挥官这夜是在一户土著人家中与自己的相好女子幽会，被他的士兵找到时，早已忘了晚间必须回堡的规矩，正在胡天胡帝玩的开心。
这位哨长当晚就被赵宣明解除职务，让第六师监军部将他撤职，取消一切军衔，成了一名最初级的下等兵。曾哨长是马六甲守备团的军官，直属郑芝龙管辖，但是现在是战时，赵宣明有权直接撤他的职。
赵宣明为淡马锡堡垒增加了两个哨250名士兵，还留下了五门青铜野战炮。护航舰队提督是南洋舰队第五分舰队海云天提督，年纪不过30岁，是海南岛琼州的疍民子弟。他亲自驾驶一艘纵帆炮舰连夜去马六甲河口侦查，和正在攻击河口堡垒的亚齐大军遭遇。海云天利用纵帆船的速度和舰上的大炮，逃出了正在激战的马六甲河口海域。当夜，赵宣明就得到了亚齐人已经开始进攻马六甲的确切情报。
眼下情况很明确了，马六甲城内在巷战，城外各农庄、庄园、商馆都在激战。这是一场大规模战役。
赵宣明立刻放出四对信鸽，分别向婆罗洲第六师驻扎地、台湾中华军总统领、靖海王尹峰告急，用得是双备份的信鸽，每两对鸽子去一个地方。同时，他还让海云天派出两艘跑得较快的纵帆炮舰去爪哇和海南，请求南洋舰队的分遣舰队立刻前来支援。
按理说南洋行军总管是郑芝龙，赵宣明是无权调动南洋范围内除本部第六师以外其他兵力的。但是现在情况紧急，他也只好以紧急求援的名义向各地调兵，监军部驻第六师的监军官在求援书上副署签名，表示了监军部的立场。
赵宣明在派出报急以及求援信使后，立刻连夜带兵向马六甲进发。他没有在河口上岸，而是在距离河口十里的一处海滩上登陆。他的一个团除了两个哨队留守淡马锡碉堡外，其余近1800名步军，200名水手陆战队员花了半个时辰登陆。护航舰队提督海云天留下十余艘福船，自己带着剩下一艘纵帆炮舰向马六甲河口进发。很快，他的战舰携带三十八门大炮，与上百艘马来人的三角帆船打成一团。
在海云天吸引了大批敌人注意力之际，赵宣明带队由红树林中穿越烂泥地。上午，他领兵突然攻击了马六甲河边的大市场。这个大市场是马六甲新开辟的贸易集市，昨日各国商人们四处逃跑，他们的货物还堆在市场内。大批亚齐兵昨晚夺占了此地，现在大队亚齐土兵如同小狗落入粪坑，一个个眼花缭乱忙着抢掠财物。河边中华商馆仓库还有一队华人武装死守，枪声喊杀声不断，但是亚齐军队的指挥官已经控制不了自己的士兵，甚至无法调动士兵攻击商馆仓库。亚齐土兵放着身边的敌人不管不顾，一头扎进玲琅满目的货物堆中，不抢个够，说什么也不出来了。
赵宣明的人马突然从红树林中冲出来，越过灌木丛和一道歪歪斜斜的篱笆墙，将正乱作一团的亚齐人打了个措手不及。他这恰到好处的一击，将以亚齐首相的私兵为主的亚齐土兵打得大败，很快就被中华军从城南、城东赶出来了。同时，大量各国商人的货物也因此得以安全保存下来。
中午时分，马六甲守备团副团长少校张魏带领本部人马从要塞堡垒冲了出来，配合赵宣明所部将攻进城中的亚齐军队全部赶了出去。海云天的战舰在战列舰飞鹰号接应下，也成功突破亚齐人的封锁，来到了马六甲河口。飞鹰号吃水太深，将亚齐船队轰散后，停靠到了淡马锡岛边。海战中，驻防马六甲的几艘南洋舰队战舰被蚂蚁般涌来的马来人帆船烧毁。
此后，战事就陷入了胶着状态。从第三天开始，亚齐人和苏门答腊各土邦军队纷纷聚集到马六甲周边，柔佛苏丹也背叛了与中华公司签订的盟约，出兵攻打马六甲。赵宣明与张魏分工合作，以第六师第一团主力负责马六甲河口和要塞面海一方的防卫，张魏带守备团留守主力及民兵坚守圣保罗山及要塞正对陆地的一面。
周边各地村庄、庄园、商馆的华人武装，在少量本地马来盟友支持下，相继向马六甲城内撤退。有些大商人开办的种植庄园不愿撤退，凭借各自建设的坞堡坚守，有些被马来人攻占，有些则不得不撤退到马六甲去。只有少数华人据点能够坚持到南洋舰队主力返回，死守到战争结束。
同时，马六甲城被马来人武装包围得严严实实。那些企图撤退进城的华人武装，经常需要城内中华军出击接应，才能在九死一生中得救。无数的华人妇孺老幼，以及一些马来人同盟者，在绝望中倒在了马六甲城外的河滩边、灌木丛中、红树林中。马六甲城制高点圣保罗山上，赵宣明、张魏等人经常能看到周边华人据点腾起浓烟，然后火光彻夜不灭。早晨，马六甲城外又会多出无数具华人妇孺老幼的尸体。
但是，马来人对马六甲的攻击，每次都让围攻者大败而归，损失大量兵力。亚齐等邦国军队，只有少量葡萄牙人、荷兰人卖给他们火绳枪，十几门欧洲式大炮。其余的大量火器都是马来人自己铸造的枪炮。更多的马来人兵士拿着长矛、短刀、铁剑参加战斗。
当北大年加入反华阵营时，倒是带来了几十门青铜大炮，据说是当年的中国海盗帮着北大年女王铸造的。
在武器火力方面中华军占有绝对优势，又凭借着坚固的马六甲要塞堡垒防御体系，在天启二年三月份的围城战**期间，马来人发动的三次动员兵力四万人以上的总攻击都被击退。