此刻，风浪已是从四面八方席卷而来，天空已经完全暗下来。大风刮破卷走了来不及收起的前桅方帆，主桅的帆布被船员们拼死放下来了，但上边的首斜桅已被暴风折断。船头一次次被卷入海浪中，又一次次挣扎出水。
尹峰和贝尔纳多两人跌跌撞撞下到舱底，这里已经集起了齐脚脖子的水。所有的人，不分肤色国籍都在忙乱，几只酒桶和板凳什么的正在人们脚下顺水流漂动。
船的龙骨前部出现渗水现象，在左舷也有大量海水渗入，底舱的水位越来越高。船员们拼命用布匹牛皮补漏洞，黑人、印度人、马来人、中国人的各种语言吵吵嚷嚷乱作一团。
船长和大副等人在甲板上坚守，舱底下几十号人完全乱了套。贝尔纳多从来没有跑过澳门以北的航线，对西北太平洋区域的台风毫无经验；曾景山常年只在大陆上经商，没有航海经验；只有尹峰，前世多次报道台风登陆新闻，加上多年野外采访的经验使他很快镇静下来。
尹峰大喊道：“船员去补漏洞，其他人排水！”他首先把曾家的家丁仆人组织起来，用一切可舀水的器具往外排水，这是第一要务：否则不但船舱里的货物会受损，船只本身也会完蛋。然后他用葡萄牙语命令船员们用一切办法堵漏，熟悉船只情况的船员们也开始专心堵渗补漏，但是情况仅仅是稍稍缓解：更多的海水是从舱口夹杂着风雨灌入的。
舷窗不可能在这个时候打开，而关了舱门就无法把水排出去，不关的话灌入的海水越来越多。
尹峰艰难地从舱门爬出去，迎面看到大副趴在舱口正欲进来，尹峰喊着说：“告诉船长，灌进底舱的海水越来越多了，但船体问题不大，怎么办？”
大副没有犹豫：“关舱门！”
船身在嘎吱嘎吱作响，风浪声越来越大。漆黑的底舱里潮湿的几乎可以从空气中挤出水来，而且越来越闷热，各种怪味在冲击人的鼻子。所有人都在顺着颠簸的船身摇来晃去，不时有人撞上船板、器物或人，发出痛苦闷哼。浑浊的水在人们的脚上滚过，带起不知名的杂物。尹峰头一次遇上这种险情，此时也只有强制自己保持镇定了。
不知过了多少时候，“轰！”船身猛然一震，一阵令人毛骨悚然的嘎吱由甲板上传来。大家面面相觑，曾家的人开始不顾一切跪在污水中拜求妈祖娘娘；黑人们则祷告祈求上帝，印度人求助水神瓦魯那，马来人则祷告真主；贝尔纳多和他的手下不停地在胸前划十字。
还好，这不过是前桅折断罢了。大副下到船舱，告诉大家风已经变小了，要求大家继续排水。
尹峰钻出船舱，现在应该已是白天了，但是眼前除了海浪和暴风雨，还是什么都看不清。向导针师林阿水正在船头看罗盘，他告诉尹峰，暴风雨已经刮了3天了，船只起码已经顺风漂了上千里了。
“那我们到底到什么地方了？”
“不晓得。”林老大干脆地说：“有段时候，我们的船是在原地打转，昨日晚间风浪最大时，船只摇晃得厉害，罗盘失去作用，已经搞不清方向了。”
船长罗德里格斯这时也来到船头，尹峰把向导的话翻译给他。船长一点也没有紧张，拍拍尹峰的肩膀说：“放心吧，昨天夜里上帝保佑了我们，只要船只没事，我们就会安全。”
“这里是妈祖娘娘的地盘啊，你的上帝大概没有用的。”当然，这句话只是尹峰心底里在说。
风雨确实渐渐在减小，到中午时分，天色也开始放亮。果阿号两根船桅折断了一根，剩下的主桅也失去了近半的帆布。另外，底舱的船员报告，储存淡水的水箱破裂，剩下的淡水最多可供全船的人使用2天。
甲板下的船员还在排出积水，尹峰和贝尔纳多上了甲板后，这风雨慢慢停止了。忽然间，东南的天边一道霞光撕破乌云，众人眼前顿时一亮：转瞬间，万道阳光剖开满天乌云，蓝色的天空猛然出现，大海也立刻驯服乖巧地平稳下来。一片翠绿色的陆地突然出现在大家眼前，还带着一条曲折的海岸线。
风暴终于过去了。
不过，果阿号已失去了前桅，还失去了大部分的风帆，已经失去了动力。船只慢慢顺着涨潮的海水和西风飘进一处开阔的海湾，前方有着沙滩和礁石群的海岸上，似乎有居民住房。更深远的内陆是连绵的绿色群山，大多隐约若烟雾。等船只靠近了海岸线，大家还看到沙滩边有简易的竹制栈桥，沙滩上停着几只小渔船。远处沙滩边的居民点是一片杂乱无章的中式建筑，有一道篱笆墙围着整个居民区，篱笆墙的出口处有大门和一座简易的望楼。
船长拿着望远镜看着那处居民点，问向导林阿水：“这里是什么地方？”
林阿水左右观察了一番说：“海盗窝。”
尹峰没顾上翻译，大吃一惊问：“海盗窝？难道是……”
“这里是魍港，这个岛就是官府所说的东番或者北港了。”
这里就是台湾岛的魍港，在尹峰的世界中就是后来荷兰人所谓的倒风内港，在台湾省嘉义县八掌溪口好美里一带，后来因为急水溪改道，洪水冲毁魍佳半岛连接陆地对外的出入口, 魍港变成孤岛，再加上航道淤积,其港口的地位就被布袋港所取代；由此往南的海湾就是大员港，尹峰前世的荷兰人建的赤嵌城就在那里。
尹峰没想到自己在这个时代，第一次出海远行居然就到了台湾，心情很是兴奋：“啊，这里就是台湾啊！！”
“台窝湾的大员港再往南才是，这里是魍港。”林阿水忙着纠正错误，没注意尹峰的兴奋表情。传说中，台湾的名称就来自“台窝湾”，荷兰人於天启四年五月〈1624〉占据安平，先筑奥伦治城後改筑为热兰城，由于其城濒台窝湾，初仅称港道，后来就转为全岛的称呼了。
当然，也有其他说法：台湾就是大员之谐音字：泉人周婴著《远游编东番记》中载有“台员”一词，现在闽南语仍读“台湾”为“台员”的。尹峰前世一直想去台湾旅游而未去成，现在突然间来到了400年前台湾，不免有点手舞足蹈起来。
而船长看着尹峰兴奋不已的样子，不明所以地问：“尹先生，这里是什么地方？能得到补给和维修吗？”
尹峰忙说：“这里是中国沿海海盗的基地，叫魍港。这里应该什么都可以搞到，……”
船长皱皱眉头，大为纳闷：到了海盗窝，你这个商人兴奋什么？
他大声命令船员从舱内拿出武器，并且命令暂时停止排水，全力修复船帆。此时刚好是退潮时分，果阿号失去动力无法操纵，只能顺着水流又开始往海面漂。但海水退潮太快，船只在一阵摇晃后，咯吱咯吱响了一阵后搁浅在离海岸线1000米左右的海底沙滩上了。只有等下午再次涨潮时才能脱离此地了。船只必须修好船帆，恢复动力才能乘着潮水离开这里。
情况很不乐观，就在大家抢修船帆的时候，从海湾东边出现了一只帆船，张着歪斜的硬式帆，船尾高过船头。有人惊呼：“是倭寇的船！”
没错，这就是所谓的“大和型”帆船，是吸取了中国硬式帆优点而建成的日本帆船，外形上船尾比船头高大。由日本来的正宗“大和型”倭寇船常挂八幡大菩萨旗，所以一般叫它八幡船。
日本船抗风浪性是很差的，这只船一定是一直在港口内躲避风浪，现在完全可以乘机会打劫一下不能动弹的果阿号。
所有人都惊慌起来，倭寇的名声是在东亚航海界臭名远扬的，葡萄牙人也和他们一直是敌友难分的。眼见这只日本船径直向果阿号驶过来，有刀枪的利刃在阳光下反光，其意图明显不是什么友好访问。
船长命令大副负责防御工作。果阿号船头船尾各有一门铜质小炮，本来就是发射散弹用以抵御近距离内海盗袭击用的；同时船上备有16杆火绳枪，5把手枪式板机弩，杂七杂八的葡萄牙刀剑几把，还有曾家家丁带的6把短刀和两根兼任武器作用的扁担。火绳枪分配给了黑人船员，扳机弩分配给几个马来人，中国人用自己的冷兵器武装起来，主要防守舱口一带。
尹峰往自己的转轮发火枪枪里装了弹药，也站到了武装起来的船员中间。黑人马加罗站到了他身边，手拿着船上木匠的铁榔头。两人对视一眼，互相笑笑。对于这个黑人，尹峰很有好感：他话不多，但勤劳肯干，而且他现在把尹峰当做他主人，一直跟着他。
日本船越来越近，船帆上部挂着的旗帜上画着八幡大菩萨图案，甲板上站满了日本浪人打扮的倭寇，船舷两边有十几把长桨在拼命划水。
“咔！”一声响，倭寇的船一顿，搁浅了。
果阿号上发出一阵欢呼，但不久就是一阵惊呼：日本浪人海盗放下了三只小艇，陆续有近30名倭寇上了小艇，划着桨继续接近果阿号。他们把小艇偏向海岸方向，然后掉转小艇向着果阿号，利用海流方向冲向果阿号商船，并且发出了一阵吆喝。
果阿号上无人懂日语，但谁都明白倭寇的进攻马上要开始了。
“呯呯”一阵乱哄哄的火铳射击声响过，集聚在甲板上的果阿号船员们纷纷俯下身，几粒日本铁炮—火绳枪子弹打在船舷和桅杆上。大副猛然大喝：“好，发射！”
准备多时的船头小铜炮发射了，“轰”的一声巨响，无数的铁砂扑向三只倭寇小艇。措不及防的倭寇顿时有五六人惨叫落水，四五人倒在小艇上惨叫。
但这帮倭寇明显都是亡命之徒，并未因此慌乱起来，没有受伤的人立刻反击，“呯呯”连续用火绳枪击倒了船头小铜炮周围的船员，包括来不及躲避的大副。众人大惊，黑人船员奔上船头，乱纷纷地开枪射击，枪响了十几下却不见再有倭寇倒下，反而几名黑人被倭寇的枪弹击倒，惨叫着在甲板上蠕动，鲜血开始流淌。
尹峰浮在船头左侧船舷下，几颗子弹从头上飞过，他手心冒汗，心脏狂跳。他已经发射了三枪了，但感觉好像什么人也没打中。第一次参加这种早期火器的战斗中，使他一时间脑子空空的，只知道射击和躲避射击。
这种火器对射的场景，对于其他在场的中国商人来说是很陌生的，曾家的家丁仆人和曾景山聚在舱门口，拿着冷兵器惊慌中完全不知所措。
船长眼看情况紧急，带着二副跑向船尾，把船尾的小铜炮拆了下来，两人抬着狂奔到船头，架到了船舷上，点火发射。
“轰！”
一阵铁砂雨泼向海面上的倭寇。可惜这次铜炮是架在船舷上的，手忙脚乱中射击角度偏高了，这一炮只把一名倭寇打翻在海水中。
但倭寇们却开始撤退了，他们已经伤亡10多人，还不清楚果阿号上还有可以发射多少炮，所以先行撤退。
倭寇撤退前一阵火铳乱射，又把船长和大副都击伤倒地，躺在甲板的血泊中呻呤。这下，失去领导的船员们更加慌乱了。
倭寇的小艇回到了自己船边，运走伤员，登上了一批生力军，然后小艇又一次划向果阿号。
而果阿号上一片混乱，尹峰站起来深吸了一口气，看着海面上的倭寇小艇：他们人并不多，只有30来人。果阿号上的船员加乘客，也还有30多人，但是已经完全处在混乱中。这样下去，倭寇的第二次进攻将轻易得手。