随后，姚启圣走马上任，也确实立即对朝廷的官吏任命，做出了相应的整改。官员考核的制度，也在几天之内就发给了各部衙门。一时间，整个南京城里的官场，几乎是地震般的改动和忙碌。各部之间也顿时没有之前的懒散之风，朝廷的效率也明显的有所提高。
朱由栋见了顿时大喜，对姚启圣的能力，也十分赞赏。见姚启圣整顿朝廷的事情，已经立竿见影，顿时也就放心了。这时大明发出的公文，也传遍了天下。听说复明军也开始要开科举了，不管各地士子信不信。顿时各地有功名的读书人，都纷纷赶往南京。
但是由于天下大战，各地的读书人情况都不很理想。所以反响是很大，但是实际赶往南京的人，却很少。而且大明又明确的规定了，已经取得满清功名的人，必须要重新在大明考取。这样一来，顿时刷下去了不少的士子。这事姚启圣也反对过，但是朱由栋没有答应。
然后湖南终于传来捷报，宋高举和李来亨配合。在长沙围城半个月后，终于攻破了长沙。年仅十六岁的康郡王杰书，在正红旗梅勒额真吴国炳和代善之后，承袭顺承郡王的勒尔锦一起，仅带了百余骑逃往江西袁州府去了。
而湖广提督董学礼，汉军旗固山额真祖泽润，长沙巡按王廷谏或是自杀，或是被杀，具死于长沙城内。长沙巡抚卢森，副将黄正卿想复明军投降。李来亨任命卢森依然留任长沙巡抚。
宋高举的军队，由于长时间作战，已经疲惫不堪。只好留守长沙，防止江西清军反扑。而在长沙城被占领的第三天，李来亨就带着降军两万，八千复明军南下。
一路破湘潭，湘乡，逼近衡州。衡州知府李光座和通判吕之绎见复明军军势大，直接献城投降。李来亨已经率领大军进入衡州城了，正在衡州城里休整。
得到这个消息后，朱由栋顿时大喜，如此一来，湖南就算是被彻底光复了，虽然还有郴州和部分永州府的州县没有光复，但已经无碍大局了。
于是朱由栋让吏部任命原剑州知府为湖南巡抚，将之前除了已经化分为湖北省的州府，组建湖南省。远湖南巡抚卢森，则任命为湖南布政使。调宋高举军中的邓时干，任命为湖南指挥使，投降的黄正卿为长沙总兵。
对于这些人命，现在没有其他人员的情况下，姚启圣也并没有提出异议，直接就按朱由栋的意思照办了。然后朱由栋又让来到南京的大都督府的众人，给荆国公王光兴传令。不求能独立攻打桂林，先等塔天保和李廷明他们从柳州的战况出来后，在做进一步打算。
而攻打浙江的苟兴旺、蒋超和杨明遇，虽然合力攻打杭州，但是杭州的清军顽强抵抗。一时间也不能攻破杭州，凡是军队损失不少。无奈之下，也只好先驻扎在余杭，时刻威胁着杭州。杨明遇则退回海宁，防止清军北上威胁苏松一带。
由于军队
的疲惫，复明军一时间，所有的战事都趋于停歇状态。浙江和江西的清军，现在对复明军的情况也不胜了解，也不敢贸然出兵。尤其是江西，湖广大军的败退，让江西的清军更加不敢轻举妄动。
逃到江西的康郡王杰书，吴国炳，勒尔锦等人，一副惊魂未定的样子。更加让江西清军也如惊弓之鸟，那里还敢出兵。只好像情况还算好的广东和福建求救，希望平南王和靖南王能发兵，抵御复明军，就大清的江山于危难。
由于各方都有所顾忌，尚可喜和耿继茂一时间又没有回应。所以整个南方都进入了平静的时间，好像根本就没有战事一般。
南边的军队，都神奇的停了下来。可是北方可不平静了，大战的火药味也十分浓郁。复明军突然攻破了南京，这让还沉浸在一统天下美梦中的大清，顿时如同当头棒喝。
以往得到消息，顺治都是大吼大叫，朝着闹着要发兵平叛。甚至有时候，还会脑残的喊出亲征的口号。但是这才听见消息后，却没有一丝动静。整个京师的官员都蒙了，怎么这次怎么大的事情，顺治居然不说话了。
记得上次海贼兵犯南京的时候，顺治都被惊的要讨回关外的啊。现在南京真的丢了，却不出声了。接着的事情，就更加诡异了。才短短的十天时间，进城就开始乱了。到处米行的人，都开始停售了。
北京的人口，就算的经历的几次大战。还有满清进城后，为了让满洲人驻进好的房子，直接野蛮的驱赶百姓，在北京城里硬生生的清理出一座内城。但是在总人口，也在六十万人左右。
其中有接近十万人是八旗家眷，他们都有朝廷的俸禄。但是其他人可没有俸禄。而且就算是有俸禄，也要买米啊。北京才多大的地方，那里能中怎么多的粮食来养活人。所以北京的粮食，一直就的依靠朝廷的漕运，和民间商人的粮船。
但是现在南京丢了，复明军又打进了扬州。这样一来，北京的粮食顿时就不够用了。这不，才十天的时间，米行就开始惜售了。本来朝廷也不可能立即就知道，民间已经开始没米了。
毕竟那些八旗子弟，根本就不是一个讲道理的人。平常大家好说好散，公平做买卖，那还好说。现在居然不卖给大爷米，怎么？你是想找死吗？我可告诉你，大爷我好几天没杀人了。你去打听打听，大爷我买米给你银子，这已经是很给你面子了。
你要真是不识相，大爷我杀了你的人，依然要拿走米，还不给银子。有了这层威胁，这些八旗大爷，当然不缺米吃。但是北京要吃米的人，不光是这些八旗和平民百姓。还有很多当官的人，他们的家人也在北京住这呢。
不管是这些人，八大皇商的人，也有不少的家业在北京。毕竟他们也的被入了旗的人，还是皇上内务府的商人。他们现在在南边运不来粮食，也运不来其他东西啊。这要是停一天，可
就是白花花的银子。
顿时几个人就急了，朝廷刚收到军报。八大商人就赶到了北京，但当时朝廷在意的是军情。你们几个小小的商人，不就是亏损几个银子吗？这比起大清的就江山，谁重要？
所以当时，这几人也没有干闹。接着这两天，见北京市面上开始出现粮食供应不足了，几人顿时大喜。一商量，顿时都联手，让所有的商铺，都开始停售粮食了。几人也知道，大清不会像大明一样，真的就任你罢卖。几人又连夜把所有堆积在京城仓库的货物，全部送去大兴。
至于为什么不送去通州仓库，是因为大清不可能只抄北京的仓库，还是送去大兴安全一些。由于这几人的停售，顿时北京城里的饥荒就开始闹起来了。很多百姓根本就买不到粮食，就算能买到，单价也已经翻了几倍。
朝廷还没有商量出怎么应对军情，有接到了城里物价飞涨的情况。顿时各部大臣，都急的团团转。但这个时候，顺治却出了问题。先前是几天不说话，现在能说话了，却满嘴胡话。
一会是朝这要领兵为董鄂妃报仇，一会儿是要带领大家撤关外。这还没闹明白，又说是崇祯来找他了。说是大清乘人之危，欺天瞒地，胆敢霸占中原。还说多尔衮来找顺治算账了，多尔衮为大清打下了江山，却被顺治鞭尸。
这简直就是奇耻大辱，他要找顺治来索命。众人闹的没有办法，只好让孝庄来劝说。结果孝庄刚一出现，顺治顿时指着孝庄就骂了起来，道：“就是你这个毫无廉耻的女人，你为了皇位，居然不顾父皇的声誉。通奸小叔子，给大清摸黑。你这是有辱国体，让朝廷威严丧尽。”
孝庄听见这话，顿时脸色一白，差点就站立不稳。原本这事，在关外根本就不是什么事。身为游牧民族的满洲人，皇帝死了，继位的皇帝取之前皇帝的妻妾，这是太平常不过的事情了。不光满洲人是这样，蒙古人也是这样。
也只有汉人注重礼教，才不会有这样的陋习。但是现在满清，自认是天下正统，再把这样的陋习带进中原，这可就说不过去了。而且现在顺治居然在众人面前说出来，就算孝庄是蒙古人，根本不在乎这些。
但是这么多年，让孝庄接触了汉文化之后，顿时也被气的脸色煞白。一旁的索尼顿时道：“皇上，慎言啊。太后这都是为了皇上的江山啊。而且还是皇上的生母，皇上你不能如此羞辱天后。”
顺治可不管，吼道：“为了我的江山，这是我的江山吗？为了这个江山，我的母亲就要不顾廉耻，和我的亲叔叔通奸？为了这个江山，我的爱妃也不能宠爱。你们经历过这种失去心爱的人的痛吗？”
孝庄在苏茉儿的搀扶下，走到顺治面前，狠狠地一记耳光打在了顺治的脸上。顿时所有人都惊呆了，就算孝庄是顺治的母亲。可顺治才是大清的皇上啊，是天子。谁敢去打皇上？