随着范头黎实力的大增，范头黎也踌躇满志，准备重建林邑，因此其命令军队不断向隋军发起攻击。
此时的黄明聪尚未完成整合，实力不足，则收缩兵力于多农城（今越南会安市西）一带，不断被动防御。
大业三年四月，范头黎率领纠集的三万人马，直逼多农城，企图彻底摧毁隋军在多农的据点。
多农往北不远便是天南港，马援立铜柱便是于此。天南港是日南最重要的对外贸易港口，自是不可以丢。因此黄明远在多农城无路可退，只得与对方决战。
此时黄明聪手上只有九千余人，还有部分新兵，难以与林邑军决战。为了破敌，他将主力至于多农城中，准备坚守。又令杨弘礼率领两千余人沿着广南河（今越南秋盆河）一路向西，迂回到林邑军的侧翼待命。
范头黎到了多农城下，多农城已经被黄明聪布置得如铜墙铁壁一般，急切之间，难以攻下。范头黎遂于多农城外挖掘壕沟，准备长期围城。
林邑军围城三月，损失惨重。
林邑军虽然声势浩大，人数众多，看起来很是回事，但其实有着致命的缺陷。那便是这些部队不是范头黎一人的军队，而是支持范头黎的多方势力组建的军队。这些人来源复杂，山头不一，甚至很多的部队的所有者之前在林邑的时候都是敌对者。因为范头黎的声势很足，这些才跟随范头黎反隋。大部分人是想着趁隋军主力返回，来一场趁火打劫，不管能不能恢复林邑国，至少可以重新划分势力范围。
但这一战出人意料，人数众多的林邑军在多农城下碰了一个头破血流，损失惨重。对于大部分人来说，他们是来捡便宜的，不是和隋军血战的。眼看伤亡越来越大，众人已经无心再留在多农城穷耗兵力，因此纷纷劝范头黎撤退。
范头黎虽为新王，但年不过二十，并没有多大的实力。朝中很多事情全由几个重臣把持，他本人根本做不得主。
此时众人商议，返回古垒洞，再做计较。范头黎虽然不太满意这个结果，但也拗不过众人。
满心疲惫的联军向南撤兵，而隋军也已经做好了反攻准备。
在联军撤退的途中，一直受命潜伏的杨弘礼率两千余人从林邑人的侧方突袭联军，早就不堪其重的联军立刻大溃。两万多人四处溃逃，溃不成军。黄明聪乃从后追上，一路掩杀。
范头黎慌不择路地返回古垒洞，身边卫兵尽皆战死。范头黎最后带着几十个人逃到一处村镇，被哗变的部下所杀，献首于隋军。
范头黎死在了逃跑的途中，林邑叛军也失去了领袖。黄明聪乃率部一路追杀，攻破了林邑叛军最重要的据点安乐城和古垒洞，彻底摧毁了这支林邑叛军。
此时张镇州也率领五千交趾部队从北方赶到，有力地支援了黄明聪。黄明聪手上兵力充足，声势大振。
黄明聪乃和张镇州兵分两路出击，黄明聪率军沿着海岸线进军，而张镇州则深入内陆。
两路隋军横扫各地的反叛势力，并在尸唎皮奈击败了另一支林邑叛军主力。
大业三年十月，隋军经过艰苦卓绝的奋战，终于彻底剿灭了林邑境内的所有叛军。
······
稳定了林邑的形势之后，黄明聪便开始逐步收权。
大隋在交趾本有三个州，即交州（交趾郡）、爱州（九真郡）、驩州（日南郡），攻破林邑之后，又新增了荡州（比景郡）、农州（海阴郡）、冲州（林邑郡）三州。
这六个州中，除了交州以外，其余五个州无论是实际控制面积还是汉家人口都很少。而且因为位置太靠南，整个岭南之地都是地广人稀，连移民都不具备可行性。
总不能从河南、河北往这里移民，不说花费，就是自然环境和气候移民一时半会也受不了。
为了便于管理，减少重叠的行政体系，也为了使得黄明聪有机会完全控制整个交趾，在大业三年的合并州县一事中，黄明远以“交趾之地民少官多，不便管理”为由，建议将九真、日南合并为九真郡（汉九真郡），比景、海阴、林邑三郡合并为日南郡（汉日南郡）。
杨广其实也对交趾之地不怎么了解，至于当地什么情况基本上都是从奏疏中看到。
合并后的九真、日南二郡的设置都是两汉时期的疆域，并不算出格，因此杨广很快便同意了黄明远的建议。
黄明远趁机表黄明聪为日南郡太守，沈映为九真郡太守。再加上担任交趾令的崔仁翰，整个交趾三郡基本上落入黄明聪手中。
林邑之地，其民源自古老的百越一族，自东汉时期便脱离了中原王朝的统治。老百姓并不向往中原文化，也对中原王朝没有什么归属感。
因此要想长久地占据此地，极其困难。
黄明聪平乱之后，先是大肆给麾下将领、士兵在林邑安家，通过联姻等多种方式，使得每人都在林邑娶了一个或多个老婆。
将士们成了家，心也安在了此地。
黄明聪乃开始对林邑之地进行汉化。除了要求所有人说汉语，写汉字，穿汉服，用汉礼以外，再通过林邑人治林邑人，提拔了一批愿意跟着隋军走的林邑中小贵族。至于那些大贵族，基本上都被杀光了。
黄明聪又在林邑设置了十五个集中管理区，每个区都是兵、民一体。为了加快荒地的开垦，提升粮食产量，把林邑变成一个粮食产区，大批的犯人被发往各个集中管理区进行开垦、种植。黄明聪以林邑人为监工，进行定额管理，又以隋人善于耕种者为技师，很快便开垦了大量的荒地，收获了大批粮食。
因为管理区内人力缺乏，黄明聪便鼓励奴隶贸易，吸收各地大量人口为奴。来往的真腊、扶南等地，大批的人口被贩卖、掳掠至林邑。而林邑的粮食产量也在剥削与残酷的压迫中，节节攀升。
整个林邑开始了一种虽然畸形但符合大隋利益的欣欣向荣。