就在通古斯大爆炸发生后不久，全世界的目光转移到了中美洲的巴拿马地区。
自从中法两国合作开发巴拿马运河后，美国便开始积极对巴拿马地区进行各种方式的捣乱，美国游说哥伦比亚政府，称大量进入巴拿马地区的华人将给当地的巴拿马人造成经济冲击，而且不利于哥伦比亚政府管理。同时，美国又挑唆巴拿马当地人连连闹事游行，抗议华工抢走了他们的翻腕，给哥伦比亚政府施压。
中俄战争期间，哥伦比亚政府不看好中华帝国会胜利，于是听从了美国的建议，对中华帝国输入巴拿马的工人和军队性质的保安提出百般刁难，造成巴拿马工程所需的水、电、材料等经常中断，致使工期耽误。
眼瞅着跟哥伦比亚政府制定的1904年凿通运河的工期迫近，法国人担心工期无法如期完成，会给哥伦比亚政府借口涨价或者中断合同，于是法国人准备出售手里的49%的股权。
美国人想要夺取这49%的股权，但是中华帝国显然不能让美国人得逞，于是中美展开博弈，而法国则趁机坐地起价，一度将股价涨至5000万美元。
美国国会的意图是无限制抬价，不让这条运河落入中华帝国手里，美国必须要守住美国的后院，而巴拿马便是美国后院的大门。
因此，美国凭借着其财大气粗的优势，将价格抬升至一亿美元。
然而，就在法国高兴之际，准备将这49%的股权转让给美国时，远东战局发生了巨变，中华帝国对俄战争取得了决定性的胜利。法国为了不让中华帝国进一步削弱俄国，不得不在某些问题上让步，其中一个关键点就是巴拿马运河问题。
在运河问题上，中华帝国携大胜之威，海军力量一夜间成为世界第二，超过法国海军，迫使法国政府不论从俄国方面还是自身方面都不可以得罪中华帝国，于是法国政府对巴拿马运河股权转让问题跟中华帝国达成了一致，最终法国政府以3000万美元的价格转让给了中华帝国。
美国政府对此非常不满，可是中华帝国强大的军力让美国海军太平洋舰队受到巨大的威胁，美国政府不敢开罪中华帝国，于是选择了退让。
而哥伦比亚政府得到中华帝国对俄战争胜利后，顿时改变脸色，不敢再在运河问题上刁难中华帝国了。
就这样，在1904年的中美博弈当中，中华帝国获得了胜利，取得了巴拿马运河的全部股权。而美国偷鸡不成蚀把米，不但没有得到法国的49%股权，反而都让中华帝国独占了。
此后三年，美国惧怕中华帝国的军力扩张，在大国博弈中处于弱势，于是从正面支持巴拿马人给中华帝国使绊子的行动中转为地下活动，支持当地的巴拿马人发动政变，以便给美国介入巴拿马制造借口，同时也想着在战火中毁掉巴拿马运河。
1905年2月，巴拿马运河正式被凿通，未来三年内将扩建运河两岸的服务设施，修建大型船闸。由于当初巴拿马运河设计时，仅仅考虑到吃水7米的战舰可以通过，但是随着中华帝国开建神弓型战列舰，吃水达到八米，未来的超神弓型战列舰吃水将更大，于是中华帝国进一步将巴拿马运河凿深，拓宽，使其可以通行吃水更高的超神弓战列舰。
中华帝国的举动令美国更加感到了紧张，很明显，中华帝国将这条运河当做了向加勒比海和大西洋投送海军力量的通道，这对美国的威胁实在太大了。于是，美国国会批准了罗斯福的提案，秘密支持巴拿马人发动政变，借机向巴拿马派兵，并想办法摧毁巴拿马运河。
这一时期，美国海军大规模建造前神弓型战列舰，并且很快把战舰总吨位提升至世界第四，在主力舰数量上压制中华帝国海军。罗斯福的大海军计划使得美**方有了底气，于是在巴拿马问题上更加嚣张起来。
随着中英战争爆发后，美国人觉得时机到了。他们不认为中华帝国可以打败英帝国，于是决定在巴拿马制造政变。
在巴拿马，美国人扶植的对象主要是大庄园主何塞?奥古斯丁?阿兰戈父子，还有托马斯?阿里亚斯、费德里科?博伊德等人。
1905年3月，美国陆军部长按照总统的指示，派出情报人员到巴拿马地峡协助亲美分子组织独立运动时，就看中了阿兰戈父子，以他们为首组成了“巴拿马爱国者小组”，5月，曾任科隆省长，并长期在美国巴拿马铁路公司任职的曼纽埃尔?阿马多?格雷罗加入了“爱国者小组”，成为其首领。
6月14日，美国《纽约世界报》发表文章，鼓吹如果哥伦比亚政府一意孤行，坐视中华帝国大规模向巴拿马移民，则巴拿马人民为捍卫自身的利益，应该脱离哥伦比亚而独立。
7月，“爱国者小组”开始讨论独立起义的具体计划，8月，阿马多到纽约会见了克伦威尔和瓦里亚，得到了美国政府将会支持独立起义的消息，瓦里亚表示，他已得到西奥多?罗斯总统和米尔顿?海约翰国务卿的明确承诺，美国政府将承认巴拿马独立并保护革命者。
1905年12月1日，美国国务院将起义需要的文件等物品交给了瓦里亚，包括军事计划、密电码、独立宣言文稿、巴拿马宪法、国旗等等，瓦里亚自己预支了50万法郎给阿马多，作为起义经费。12月20日，阿马多返回科隆，他虽对此行的成果感到欣慰，但又觉得光凭一个法国人的承诺，就拿自己的命运、事业甚至生命去冒险有些不妥，关键时刻，阿马多的妻子多尼亚?玛丽亚给了他巨大的精神支持。这时，经过革命者的游说再加上5万美元的赠款，哥伦比亚驻军司令埃斯特万?乌埃尔塔斯决定加入“爱国者小组”，这对起义来说无疑是雪中送炭。
很快，阿马多又用3.5万美元收买了一位哥伦比亚炮艇艇长，事情发展到这一步，哥伦比亚政府终于察觉了巴拿马政局的异常动向，立即派2名将军率领40名士兵乘一艘炮艇前往科隆，以防非常事变，但此时美国巡洋舰“纳什维尔”号突然开进科隆港，公开阻止哥伦比亚军队进入巴拿马城。
1906年1月3日，两位将军刚到巴拿马城就被已经叛变的乌埃尔塔斯逮捕了。阿马多通知美国领事馆，巴拿马已经与哥伦比亚正式脱离关系，阿兰戈父子在巴拿马城的大教堂广场，当众宣布成立巴拿马临时执政委员会，委员会的成员包括巴拿马精英分子和美国铁路公司的高级职员。
当晚，巴拿马市议会举行特别会议，承认了这个新政权。而哥伦比亚政府面对美国的巨大军事压力，也不敢吭声，默认巴拿马独立。
1月4日，巴拿马举行群众，宣布独立，推选阿马多为共和国首任总统，阿马多在会上致辞时高呼：“巴拿马共和国万岁！罗斯福万岁！美国万岁！”的口号，成为世界外交史上的一个趣闻。
对于巴拿马的独立，一位美国参议员写道：巴拿马人民是站起来了，像11个人一样！因为巴拿马独立起义是在美国支持下，由7个巴拿马人和4个美国人策划的。古斯塔夫?阿道夫?梅利安德写道，“巴拿马是为了便宜而嫁给美国”，是一个“损害主权的杂种国家”。埃里克?莱昂则认为，巴拿马是一个“得了萎缩症的国家”。
巴拿马独立后，美国立即催促新政府废除修建巴拿马运河一事，全部赔偿金由美国支付。瓦里亚也被巴拿马政府任命为驻美国公使，授予他跟美国签订运河条约的全权。
此时，中华帝国正处于对英国作战的关键时期，不想把美国扯进去。因为王辰浩很清楚，当年如果不是美国不断的向英国输出战略物资，英国在德国的潜艇战打击下，根本坚持不到一年就得投降。因此，中华帝国在这个时候不得不对美国退让。
然而，中华帝国即便暂时退让也是有目的的，跟巴拿马政府谈判不断的拖延时间。巴拿马要收回运河，于是中华帝国就开出20亿美元的天价，以为可以吓唬住巴拿马政府。岂料美国人为了夺取这条运河权利，竟然支持巴拿马政府同意。
面对这种情况，中华帝国政府已经知道美国对巴拿马运河势在必得了。在王辰浩看来，巴拿马政府20亿美元收购这条运河，肯定是美国人掏钱，之后美国人将获得运河运营权，但至少需要12年才能收回成本。
此时，中华帝国已经对英国形成了一定的优势，而且中华帝国正在暗中组成八国集团，一旦完成八国联军对英战争的态势，则王辰浩就可以高枕无忧了，因为英国肯定打不过八国联军，战败是必然的。
王辰浩心中有数了，但美国人在巴拿马问题上始终跟中华帝国作对，必须要狠狠的教训美国人一顿才行，让美国人吃个大亏才能解王辰浩的心头愤怒。
公元1906年4月，中华帝国同意了巴拿马政府的要求，愿意将巴拿马运河以20亿美元的价格还给巴拿马政府。
中华帝国代表特意强调是还给巴拿马政府，而不是转让给美国，这个字眼并没有被巴拿马政府和美国政府所重视。双方于是很快签署了合同，但中华帝国要求必须把钱款付清之后，才可以将运河转给巴拿马政府。
对此，巴拿马政府和美国政府协商后，立即同意了。
1906年9月，中华帝国已经取得了对英作战的辉煌胜利，和英国签署了停战合约，这让美国感到了来自中华帝国的巨大军事威胁，但是此时美国政府认为中华帝国已经签署了合同，自然不可以反悔，因此美国政府紧急筹集了20亿美元的资金，要求巴拿马政府立即跟中华帝国换约。但是20亿美元的资金不是那么容易筹集的，美国政府跟美国民间大商人们借钱，直到第二年夏天才筹集到这笔巨款。
1907年7月13日，中华帝国同巴拿马政府签署了运河权归还给巴拿马政府的合同，巴拿马政府将从美国获得的20亿美元转交给中华帝国政府。
按照合同规定，中华帝国在得到20亿美元的赎买费后，将运河交给巴拿马政府。随后，巴拿马政府立即跟美国谈判，准备将运河卖给美国。此前，美国已经花了20亿美元了，根本不想再掏钱了，但是巴拿马政府刚刚成立，急需要资金，必须跟美国要钱。于是，双方展开了口水战，僵持了下来。
美国对于巴拿马政府非常不满，于9月20日对巴拿马发出警告和威胁。美国海军舰队分别从大西洋和太平洋两个方向上靠近巴拿马，迫使巴拿马政府不得不屈服，最终以100万美元的价格把运河权让给美国。
然而，就在这时，巴拿马政府议会不承认在巴拿马的华人地位，要求驱离华人，并且规定了时间表，必须在三个月内离开。而华人在巴拿马的总人口已经达到了50万人，超过巴拿马人10倍，而且已经获得了哥伦比亚政府签发的哥伦比亚国籍，巴拿马独立后，他们自然转为巴拿马国籍。然而，巴拿马人拒绝承认这五十万华人的巴拿马国籍的合法性。
中华帝国于是向巴拿马政府施压，迫使巴拿马政府同意。巴拿马政府见中华帝国打垮了英国，军事实力跃居世界第一，根本不敢强来，因此只好承认。
1908年3月，巴拿马议会选举，巴拿马人拒绝让华人参加投票，遭到华人强烈抗议，中华帝国再次出面，对巴拿马政府施压，大西洋舰队开至科隆城外，太平洋舰队开至巴拿马城外，面对中华帝国海军的那些巨舰大炮的威胁，巴拿马政府寻求美国政府支持，但是美国海军根本不是中华帝国海军的对手，只派几艘巡洋舰在附近转了一圈便离开了。于是巴拿马政府不得不屈服，宣布巴拿马籍华人有权投票。
1908年5月，在巴拿马的华人组建了巴拿马民主党，并参加巴拿马国会选举。由于巴拿马籍华人是巴拿马土人的五倍多，民主党一举夺取巴拿马国会的参议院和众议院多数席位，首领吴耀华一举夺得巴拿马总统。
吴耀华当选巴拿马总统，顿时让巴拿马人感到了无比的悲催和愤怒，欧美各国更是大跌眼镜。
吴耀华当选总统后，立即宣布美国获得巴拿马运河经营权为非法，因为巴拿马政府花了20亿美元从中华帝国购买回来，去以100万美元的低价转给了美国，吴耀华宣布立案调查，宣布前总统阿马多贪赃枉法，要求美国至少出资20亿美元才可以获得巴拿马运河权，否则将收回。
美国政府显然非常的愤怒，这明白着就是坑美国吗？美国政府不同意掏钱，于是吴耀华宣布收回巴拿马运河权。
1908年8月3日，美国国会向巴拿马政府发出警告，称这是在向美国宣战。
第二天，吴耀华宣布巴拿马成立国防军，征召3万华人入伍，同时向中华帝国称臣，要求中华帝国保护巴拿马不受侵犯。
8月5日，中华帝国外交部正式接受了巴拿马政府的请求，将巴拿马列为中华帝国联邦附属国之一，地位等同琉球王国、朝鲜王国和缅甸王国。
此举顿时激起巴拿马原住民的抗议，双方很快爆发流血冲突，而且愈演愈烈。
8月10日，阿马多宣布重新组建巴拿马政府，并组织了一千人的军队。
8月12日，吴耀华完成了国防军的组建，由于国防军的兵源本身就是中华帝国退役军人组成的，所以简单训练就形成了战斗力。加上大西洋舰队带来了他们所需要的武器装备，很快这支三万人的国防军就变成了武装到牙齿的老虎。
8月18日，吴耀华下令镇压原住民的命令，三万如狼似虎的国防军顿时对巴拿马原住民进行镇压，不到一天就打垮了阿马多的反抗军，并借机扩大了攻击范围，大量巴拿马原住民被冠以“反抗军”名义击毙。
8月20日，巴拿马国防军夺取了巴拿马运河，驱逐了所有在巴拿马的美国人。
美国政府极为愤怒，鹰派要求立即对巴拿马宣战，然而罗斯福政府却没敢宣战，因为巴拿马已经成为中华帝国的联邦附属国之一了，对巴拿马宣战就是对中华帝国宣战。显然，美**力无法跟中华帝国抗衡，宣战是自讨苦吃。
美国政府于是试图用外交渠道来解决巴拿马运河问题，提出当初巴拿马政府用于支付给中华帝国的20亿美元为美国政府掏的钱，如果巴拿马政府要收回运河，需要归还美国这笔巨款。
然而，吴耀华却坚决不承认有这件事。称那是阿马多非法跟美国签署的合同，巴拿马新政府没有任何关于这件事的记录。中华帝国政府也表示20亿美元是从阿马多手里获得的，跟现在的巴拿马新政府无关，就算归还美国用于购买巴拿马运河的费用，巴拿马新政府也只需要给美国一百万美元而已。
美国政府直到这时才恍然大悟，难怪当初中华帝国这般好说话的将巴拿马运河让出来，原来早就算计好了。这次着实是狠狠的坑了美国一把。
美国政府愤怒异常，美国国民也是抗议声不断，然而罗斯福政府依然不敢对巴拿马开战。
此时正值美国总统大选，罗斯福连任一事顿时泡汤，罗斯福政府被迫集体辞职。