此时外太空的大战早已结束，星球上的黑云再次像王宇他们初来乍到时一样无踪无影。
在王宇看不到的深海之下，亚特兰蒂斯文明的数百座城市早已成为海底废墟，不留一处避难所……
在废墟之上的海洋里还有数万台机甲战士巡弋着，搜寻可能存在的幸存者，并将其击毙。
“第47机甲中队报告，没有发现幸存者。”
“第13机甲中队报告，c区域搜索完毕，没有发现幸存者。”
“第689机甲中队报告，城市下方发现疑似避难所的气室，但里面除了尸体什么也没留下来。”
“嗯，应该是被洛伦斯之耀的附加辐射杀死了，这片区域没有幸存者了，搜索其它地方。”
游弋在海底的圣殿机甲群来回扫描着可能藏匿幸存者的地形，但收获甚微。
如果王宇能听到这些部队间的通讯，就会发现他们很奇怪……他们对自己犯下的屠杀罪孽毫无感觉，交流之间不带任何感情。
与正常人相比，他们更似一群包着人类外皮的机器人！
也许是舰队的饱和式轰炸及其突然的时机，幸存者几乎没有。
机甲部队也找到不少地下隧道与疑似避难所的气室，但都没有发现里面有人。
“全部听令，没有发现幸存者，返航！”
最终，指挥官在反复搜索后，下令返航回舰队。
几个小时后，与异形战斗中吃了不小亏的圣殿舰队在回收深入海洋的机甲部队后，终于启程返航了。
徒留一个满目疮痍的“宜居星球”……
然而圣殿舰队没有发现的是，亚特兰蒂斯人经营这颗星球千年之久，怎么可能没有点自己的东西呢？
……
早在王宇等人的科考舰队抵达外层空间时，他们安放在水面上的天眼就已经看到了，于是事先便预备启动了“种子计划”。
即武力抵抗与外交谈判双失败后，利用他们贯穿全球海底的海底矿洞，将其抽空海水改造为一个个避难所等待梅菲斯特的降临毁灭，能使他们留下文明的火种。
一开始误以为外交胜利的他们，暂缓了种子计划，然而至高拉达突然而至的警报将亚特兰蒂斯高层从梦中惊醒，还在笑望外太空舰队与异形厮杀的他们无不一脸懵逼……
还没来得及转移他们的“种子”，外太空的那道绿色光束便穿透大气层，降临在浅海地区……其造成的冲击之力甚至“掀开”了距离落点最近城市的天穹系统。
300万人还没来得及逃进避难所便窒息在深海之中。
重新启动的种子计划刚刚开始，第二发来自地狱的幽光便降临在首都亚特兰蒂斯市附近。
接踵而至的便是太空舰队各级主炮的连番轰炸，一个个亚特兰蒂斯城市在轰炸中毁灭，无数活生生的人类没有死在异形之下，反而丧命于自己的同胞之手。
然而，就算圣殿机甲部队的搜索在怎么严谨，也总有“漏网之鱼”……
距离首都亚特兰蒂斯市西南方向三百公里的一处原海底矿洞内，一群幸存者正瑟瑟发抖的躲在被改装为避难所的一个个小型房间里，等待命运的审判。
“咚咚！咔！”
“啊啊啊……”
“不要吵！小声一点！”
每一次发生震动或者大的声响，都会在这个狭小的避难所里引发一声声低吟的尖叫声。
他们很害怕，甚至都不知道外面是什么东西在猎杀他们……因为他们只是一群9到18岁的孩子。
当时只听到尖锐的防空警报声响，他们便被自己的家长、老师、大街上巡逻的军队抓进了一辆大巴，然后进入了他们以前从未使用过的避难所。
之后被地下轨道运送到连他们也不知道多远的一个避难所，然后被锁死起来。
一脸懵逼的他们还不知道发生了什么，但有年纪稍大的孩子发现了这里拥有联通市政交通视频监控的监控画面。
然后他们亲自目睹了城市的毁灭！
某个还在运作的摄像头，拍下了一台马克七型人形机甲的模糊模样，有人认出了那是与之前新闻节目里出现过的“梅菲斯特人形机动兵器”！
“是梅菲斯特！”
“恶魔终将降临，历史书里的内容是真的！”
“骗子！恶魔！”
年龄大的孩子们一边瑟瑟发抖，一边害怕。
阿洛伊西娅抱着孤儿院带出来的婴儿，听着其它孩子的猜测，一边安慰属于原本孤儿院的低龄孩子们。
这里的孩子们大多数都是孤儿院或者贫民窟的，因为距离避难所入口最近，军警第一时间将他们塞进了古老的轨道电车里。
他们只有一半人成功进入这个避难所，另一半原本是下一批次，结果他们刚进来，剧烈的震动就爆发了……
也许，他们将是这颗星球唯有的幸存者。
“妈妈……呜呜呜……”
“该死的梅菲斯特！！我的家人啊！！”
待时起时落的爆炸振动结束一段时间后，被恐惧害压制住的伤感、对毁灭他们家园的“梅菲斯特”憎恶感涌上心头。
咒骂声、哭喊声充斥在这狭小的空间之内，而那监控画面恰巧停格在马克七型机甲发射导弹的画面……
“都静一静！！这个避难所没有粮食与食用水！我们该怎么办？”有人发现了空空如也的仓库。
“什么？！这不可能，政府一直要求每个避难所没三年更新一次物资储备！”
随后，众人沉默了。
他们都出自贫民窟，自然知道上层少数人为了利润，做出什么事！
为了获得可观的政府订单，无良公司制作了假的公司报表与物资清单，再贿赂相关验收人员……
只是受害的终将是他们自己的民族。
雪上加霜的是，原本就是备用能源运行的避难所电网开始失去电力，就算有着足够的食物与水，缺乏电力的他们还是会死于窒息，最终还是会成为海底的一具具尸体。
与外界不同的是，至少他们还有彼此陪伴。
这种情形持续了一天一夜，氧气含量的降低使他们不得不绝望的只能自暴自哭泣、亦或与周围的人相拥在一起等待死亡降临。
“咚！”
忽然，熟悉的爆炸撞击声再度传来。
这一次没有人害怕或者哭泣，因为他们知道自己反正是个死，内心早已麻木。
“咚！”
撞击声越来越近，靠近壁面孩子靠着身体本能缓缓爬开。
“咚！”
墙壁碎裂，一台顶着探照大灯的马克七型机甲出现在他们眼前。