郭君镇亲自部署了顺军的猛烈攻击，大顺军在夜色里，布阵于大宁城西，傍山依水，排枪而进。
准军在一片漆黑中，望见数量惊人的火把，惊恐之下认为顺军主力已经抵达大宁，士气顿时暴跌。
担任先锋的顺军骁将李元胤冒死奋勇以斗，以身先旗，矫尾属角，直贯其骑，出其左右，连破准军数阵。
正在左翼的权将军李玮群看见一处山丘上有骆驼放炮，猜测其为僧格浑台吉的大帐位置，于是也分兵一支，攀山越岭仰攻准噶尔军的驼城阵地。
僧格浑台吉并非他弟弟葛尔丹那样的军事天才，出战以来屡屡得胜，主要还是因为战略形势有利于准噶尔人。
在具体的战术指挥上，他的能力是很明显不如葛尔丹厉害的。
可惜葛尔丹在雪区作战，手下没有准噶尔精兵，仅有一些不堪一击的藏军而已，根本无从发挥他卓越的军事指挥才华。
本来顺军仰攻驼城，很可能造成巨大伤亡。
可是关键时刻，僧格浑台吉摸不清顺军援兵的兵力，他认为自己尚有三四万兵马分散在漠南草原各地游牧就食，没有必要现在就和顺军决战。
不如暂且先行撤退，等到重新聚集兵力以后，再来和顺军会战。
僧格浑台吉心生怯意，决定逃跑。他抛弃了正在阵前和大顺军激战的喀尔喀友军，独自率领卫拉特人撤离了战场。
本来蒙古军队兵力就没有太大优势，僧格浑台吉突然带着准噶尔人逃走，只剩下喀尔喀部一军，自然不是郭君镇的对手。
大宁城中的守军也趁机出击，大败蒙军，斩首约四千级。
郭君镇随后指挥两路兵马，在黎明时分大胆追击准噶尔人。由于局势混乱，僧格浑台吉在乱战中同其部众失去了联系，提前撤离战场的准噶尔人突然丧失主帅，顿时失据，还是被大顺军追上。
两军再战于落马河南岸，准军损失惨重，光是被困在河边，互相践踏踩死的就不计其数。
大宁之战和落马河之战后，准噶尔人虽然在漠南各地还分散部署有三四万骑的部队。但由于郭君镇携两战大捷之威，又宣布由顺朝官方直接向旅蒙商收购所有蒙古牧民的高利贷欠条。
郭君镇一把火将所有欠条烧毁，以此挽回东蒙古诸部贫苦牧民的人心。
许多本来依附于僧格浑台吉的察哈尔王公，在大宁之战、落马河之战以后，也立即翻脸，跳回了顺军阵营，重新接受了顺朝的各种侯伯爵位封号，还各自起兵截击准噶尔人的北撤。
僧格浑台吉的战术指挥能力不太厉害，但战略眼光却很高明。
他单骑出逃以后，看出了漠南不可为的局面，便直接放弃整个漠南，将残余的准噶尔和喀尔喀联军全部撤回漠北，准备长期占据漠北，慢慢经营重新统一蒙古的大业。
然而就在这个时候，刘芳亮远征天山的计划已经取得了重大战果。
当时僧格浑台吉已经带走了准噶尔人绝大部分的可战之兵，在天山老家和新占领的伊犁、喀什一带，总共只留下了可战部众不足二万人。
李来亨为了彻底平定朔漠，摧毁蒙古人复兴的最后一丝希望，对刘芳亮寄望极深。
就算是表弟会宁王李淳和被包围在大宁，生死不知的时候，李来亨还是将一切资源向西军倾斜，为刘芳亮四万人的远征军，配置了多达十余万匹的骡马。
刘芳亮进军极快，大顺军一路势如破竹，全力前进，进入天山南麓后终于遭遇到了准噶尔人留守的主力军。
为了争取时间，刘芳亮直接下令“无论何队精兵”，只要马匹还有力气，都要迅速奔赴古轮台一带参与会战。
为了争取一战全歼准噶尔留守主力，取得速定西北的效果，刘芳亮要求各部放弃一切当前作战任务和目标，唯以向轮台战场附近汇合为唯一任务。
命令下达以后，各部顺军纷纷放下当面作战任务，甚至放弃了沿途攻占的一些绿洲小城镇，集结一切可以集结的兵力赶往会战主战场。
为了抓紧时间，果毅将军吕泽只率领二百多名士兵便星夜跨越天山，从北麓赶到南麓，奔赴轮台参战。
结果沿途遇到了三千多名敌军，寡不敌众战死。
李来亨认为这种不肯于中途退避自全，惟知直前冲击，以致效命捐躯的忠勇之气，深可嘉悯，追封吕泽为伯爵，由其子承袭，三代不降爵。
制将军张国武带领五千骑兵首先赶到战场，与准噶尔人交锋作战，连续奋战四天以后，虽然牵制住了准军的转移，但由于马匹长途跋涉疲惫至极，不能击败敌军。
当天夜里正好遇上康大眼带领一大批战马到达，张国武遂立即命全军换马，重新投入战斗。
大顺军分为两翼左右包抄进攻，与准噶尔人激斗一整夜，两军皆死伤惨重，尸骨遍满山谷，各自阵亡锐士千余人。
准军遭此败绩，又发觉刘芳亮、李懋亨的大军主力正在全速赶来，并决定退往伊犁坚守。
刘芳亮得知准噶尔主力已经向西逃跑，他认为追击是目前最为要紧之事，以顺军马力尚有余，而准军则携带大批妇孺老弱，行走肯定不能便利，人多易容易发生溃散，因此决定绝不休息，继续追击。
刘芳亮亲自督军追到伊犁，大顺军在不分黑天白夜的疯狂追击下，军中已经疫病横行，病死、冻伤、掉队者多达七八千人，跟随刘芳亮抵达伊犁者，只剩下了一万一千名将士、骡马八千多匹。
准军在伊犁和喀什等地尚有可战部众一万四千余人，刘芳亮因此决定采取恩威并施的手段，他释放了准噶尔军中的一批回回，使其回到喀什一带以后，宣讲顺军仅诛卫拉特蒙古人，而不与回回为难的政策。
这种做法激起了喀什守军的动摇，最终在左右摇摆下，喀什守军杀掉了城中的准噶尔驻军，关闭城门，拒绝蒙古人入内。
大顺军趁机向伊犁河谷一带，发起了最后的猛烈攻势。
这一战的激烈程度已到空前地步，准噶尔人极为耐战，顺军又因为长途跋涉体力耗尽，也没有携带重型火炮，全靠战士的一腔血勇和燧发枪的火力支撑。
一部分回军也帮助大顺军作战，分担了刘芳亮的一部分压力。