eva的世界，远在生命诞生之前就有两个来自外太空的神秘生命体一前一后分别来到了地球，它们是‘黑之月’中的莉莉丝以及‘白之月’中的亚当。两者之间存在着类似雌雄之间的关系。
白之月落入南极，之后被人类发现，当人类试图和第一使徒亚当相‘接触’的时候，亚当的苏醒引发了第二次冲击。
黑之月则在nerv本部的地下，里面的第二使徒莉莉丝被人类封印在里面。
亚当苏醒后，他产出了使徒之卵，众多使徒都是从这里面诞生的。在本能的吸引下，使徒们会主动向着nerv地下深处的第二使徒莉莉丝靠近。只要两者接触的话，第三次冲击就会产生，到时地球上的人类就彻底灭亡了。
它们的关系就好像是精子和卵子一样。使徒就是精子，他们互相之间保持着一定的竞争关系，所以使徒是不会一涌而上的。而莉莉丝就是卵子，两者的接触是为了‘新生命’的诞生。这是高飞根据目前得到的情报得出的结论。
虽然高飞很好奇诞生的那个‘神’究竟是什么样的，不过如果代价是人类毁灭的话，还是算了吧。
看着天空中出现的一个黑点渐渐变大，高飞耳边的通讯器里传来葛城美里的声音：“全体各就各位，二次数据已经不能指望，所以出发后以现场各自的判断为最优先。一切都赌在你们身上了。那么，作战开始！”
随着她的命令，第三新东京市的三个方向上顿时传来一阵阵的轰隆声，那是三台eva全力奔跑时发出的巨响。
巨大的机体每在地面踩上一脚都能引发巨大的破坏，产生的冲击波足以把远处的车辆掀翻。
高飞立刻让琳芙斯发动了飞行魔法，向着高空中第八使徒下落的方向追去。飞行的过程中，他看到三台eva以异常惊人速度奔跑着。
“这就是at力场吗？”高飞感叹。他们的速度已经接近音速了，要让如此巨大的机体达到如此高的速度，那可不简单。而且高飞还看到初号机在这样的高速下还能进一步加速，一个跨跳就轻松跃过了一座小山，可谓震撼之极。
第8使徒下落的速度非常快，见有人拦截，它的轨道开始变更，加快速度向着另一边偏转。而那个地方，只有初号机有机会赶上。
情况危急，初号机急忙改变方向向着落地点奔去。在at力场的助推下，它的速度再次飙升。
而空中的第8使徒，它的外型也发生了改变，原本由at力场构成的多层外壳一层层剥离，逐渐露出里面的本体。
展开的本体像巨大的花朵，彩虹色的花瓣边缘长满类似纸人一般的黑色鞭毛。而中间，是一个巨大无比的眼球。
“好大！和它一比，巨龙都显的异常渺小。”阿尔托莉雅飞在高飞的身边，见到空中的庞然大物，她瞳孔一缩。
“是有点大的过分了！”高飞也注视着空中那遮蔽整片天空的使徒。“这体积已经快赶上歼星舰了。展开的双翼起码十公里以上……eva的at力场真的能接住这样的家伙吗？”
高飞加快了速度，他有点担心碇真嗣的安危了。
十几秒后，高飞赶到现场，看到初号机正全力展开at力场，接住了落下的第8使徒。
八边形的at力场牢牢的顶住下落的使徒，强大的力场使得地面的石块都漂浮了起来。而不甘心失败的使徒从眼珠部位的中心处生出一个头部是白色面具的类人生物。它的双手变成两个矛一样的东西，贯穿了初号机的at力场，并直接刺穿了初号机双手的手心。
耳边响起碇真嗣的惨叫声，高飞知道他不能再等下去了。和阿尔托莉雅对视一眼，她立即会意，站到高飞身前开始蓄势。
黑之骑士再次出现，她一语不发的直接对准那个人形生物就发动了宝具。“excalibur——燕返！”
阿尔托莉雅这次直接发动了自己新近领悟的绝招。在多重次元曲折下，她在同一时间内发动了三次宝具。三次叠加的威力引发了某种质变，所产生的破坏力超乎想象。
巨大的金色光柱从她的手中发射出去，擦着初号机的肩膀直接贯穿了初号机和使徒的at力场，一下就把那个生物的大脑击碎。光柱仍旧未减分毫，接着在使徒的眼球上开了一个巨大的洞，最终消失在使徒背后的天际深处。
如此惊人的威力，一下就惊呆了指挥部里所有看到这一幕的人。
不过使徒仍然还活着，它的核心并没有被光柱击中。被击破的at力场很快就被修复，并且更多层的at力场被生成出来。
这下虽然初号机的危机暂时解除了，不过他的能源却已经进入了倒计时。at力场的展开需要庞大的能源，每一秒都在加速缩减初号机的行动时间。
魔力几乎耗尽的阿尔托莉雅立即被高飞收进了文明之书，接下来就是他的工作了。
这时，明日香的二号机终于赶到，她拔出配备的高波粒子刀，一个起跳就扑向使徒的眼球中心，那里的一个不断做着无规则高速移动的红色球体就是它的核心s2机关了。
半途中和掉使徒用来阻挡她的at力场，明日香一刀捅过去，却发现没有命中。高速移动的核心已经超越明日香的神经反应了。在这样的情况下，想要用刀刺中几乎是不可能的事情。
这时，使徒似乎也感受到了危机。两边的花瓣一下像翅膀一样扇动起来，以它巨大的体型，每动一下都能引发比台风还要猛烈的狂风。
最重要的是，它背后一直存在的圆环型at力场被移到了眼球的正面。
圆环开始逆时针转动，产生的at力场犹如涟漪一般不断出现，叠加。这样的话，光凭二号机根本就无法中和全部at力场。
明日香急的跳脚，却根本奈何不了逐渐增多的at力场。忽然，她看到高飞来到了初号机的肩膀上。
耳边响起高飞平静的话语：“明日香，你做好准备，我帮你开路。”
接着，高飞召唤出圣剑，闭眼，开始感受圣剑的魂之波长。这次高飞不准备动用小白了。即使他自己没有灵魂，也可以模拟出独属于自身的魂之波长。
高飞外放的精神力在思维们的调整下开始发生质变，按照自身的精神力特性，以圣剑的魂波为参考，开始构架灵魂的外壳。
只花费了不到一秒，高飞就再次睁开眼，大喝道：“魂之共鸣！”
一瞬间，明日香感觉到了四周的空间被冻结了。当她怀疑这是不是幻觉的时候，就看到以高飞为中心，巨大的白色火焰升腾而起。无论是初号机还是使徒的at力场，在这火焰下都犹如纸片一般被点燃。
“喝！”的一声，白色火焰一下收缩，化为一个巨大的白色球体，向着使徒的核心飞去。中途的at力场全都像玻璃一样被击碎。
就这一击，使徒的大半眼球就被火焰球体湮灭掉。不过它的核心还在，幸运的躲过了高飞的全力一击，只是有小半被白球擦到而消失了，这让它看起来像是被咬了一口的红苹果。
不过虽然道路被打通了，可是还在高速移动的核心仍然不是明日香能够击中的。
就在这时，零号机及时现身，凌波丽丝毫不顾被使徒污染的危险，直接用双手抱住了使徒的核心。
抓住机会的明日香使出全力，一刀刺中靶心，还觉得的不放心，又从背后抽出一把备用的粒子刀，把它也插了进去。最后她更是用出最后的力量，用膝盖把整把刀连刀柄都踢了进去。
在这样的攻击下，使徒那直径近四十米的红色核心球体终于出现裂缝，碎成了两半。
正好在初号机的电力耗尽的那一刻，第8使徒的核心被击破。
当大家正准备松一口气的时候，使徒那巨大的花瓣型双翼却一下向下合拢成一个黑色的球体，把三台eva和高飞以及一大片土地都包裹了进去。
与此同时，那裂成两半的核心再次合拢，颜色却变成了漆黑。
巨变在短短的几秒间发生，明日香等人还没明白发生了什么事情，就陷入了无尽的黑暗之中。