再次从基地中苏醒所谓申宫若愚走出了闭关之地，一路走来他发现基地的变化很大，问了无处不在的智脑盘古之后才知道自己已经闭关不出快两年的时间了。
难怪基地的变化如此之大，随着赛博坦科技被一点一点的被应用到基地的各个方面，每天都有大量的科学技术与科学壁垒被攻破，然后运用吸收到基地的科技体系当中，整个基地呈现出一种勃勃生机，每天都有很大的变化和改变。
在通过盘古通知众多科学家一起开会之后，申宫若愚就在会议室里吃起了两年来的头一次饭食，虽然在闭关的时候，自己没有什么感觉，身体机能也降低到了最小的消耗，但是就算他的身体比普通人强了很多，此时也感觉到一阵饥肠辘辘。
在大部分科学家到齐之后，申宫若愚终于艰难的从食物中抬起了头，神色也一下子阴沉了下来，原来他发现大部分被他用心灵宝石控制的科学家都已经冲破了他的控制，他们的眼镜都变回了原来的颜色就是最好的证明。
脸色不太好的申宫若愚静静地看着这些科学家，而这些科学家也有些神思不属的看着申宫若愚，场面一下子安静了下来，最后还是诺顿博士站了起来代表这些科学家对申宫若愚做了一个交代，原来在随着科学技术的不断提高之下，尤其是超级t病毒血清的实际应用，这些科学家都接受了注射，以期望能够更好地进行科学研究，而随之而来的就是**和精神的不断提高，最终冲破了心灵宝石的控制。
起初也有几个想要逃跑甚至占领这个基地的科学家，不过在最后都被无处不在的盘古，以及阿西福德博士等人的安排下失败了。
而大部分科学家其实都是很单纯的人，他们感觉自己在这里很开心，每天都有做不完的实验还有学不完的知识，也没有人强迫他们必须研究什么，生活待遇更是没的说，想要什么都能被满足，他们感觉很满意，也就从来没有过其他什么别的想法。
最后诺顿博士希望申宫若愚能够相信他们，如果真的不放心，可以在他们的体内安装一些小保险，甚至同意申宫若愚对他们再次使用心灵宝石。
深思后的申宫若愚当然没有那么做，他选择了相信这些单纯的学者。
会议结束，在通知他们要加快基地的改造以及升级还有科技研究等事项之后，申宫若愚通过盘古了解了一下这些年来外面世界的变化，得知这些年来在他忙于建设基地的时候外面并没有什么太大的改变，只是在原有基础上稍微前进了一些之后，思考了一下的申宫若愚立马明白了其中的原因。
他知道并不是科技没有进步，而是这其中牵扯了太多的利益与变革，就拿石油产业来说，随着科技的不断进步，他相信在一些国家或者高端实验室甚至军队，小型的核裂变技术甚至核电池已经开始了实际运用。
至于为什么没有普及开来，并不是不想而是不能，因为这其中牵扯的人和利益太大，甚至影响到整个世界的能源体系，而现在的既得利益团体不会允许这样的事情发生，就算强行推广也可能引起世界经济体系的崩溃，而且因为新能源而失去工作的人数将达到一个无法想象的地步，再加上相关的产业链，恐怕到时候会导致第三次世界大战的爆发！
所以只能在等待石油天然气的彻底枯竭之后，并在此之前慢慢的自然而然的推出新的能源以达到平稳过渡，而现在的各种电器以及电动汽车，都是这一铺垫的开始。
想通了这些的申宫若愚刚走出会议室，就被盘古的一个消息给说的愣在了那里，原来他当初救下来的那个女孩孙玉，竟然还在基地的浮空山上，当初自己只是想要留下她几天，然后放她回去，通过她放出仙家门派真实存在的消息，结果自己在穿越回来之后一下子闭关了两年，在没有自己命令的关系下，谁也没有敢放她离开，就这样在这里住了快两年的时间。
有些头大的申宫若愚询问着孙玉这两年来的情况，结果又收到了一个“惊喜”，原来在他闭关的时候，盘古经常经常利用三维立体影像装作他的样子与孙玉交流，并在一年前拜了“自己”做师傅，目瞪口呆的申宫若愚不知道应该说些什么了，看着有些不好意思的盘古申宫若愚呐呐地说了句“你又调皮了”。
但是既然事已至此自己只能想一下能教给孙玉些什么了，绞尽脑汁的申宫若愚发现自己虽然经常冒充仙人，但是自己并不会什么修炼之法，有些头疼的问着盘古有什么办法，盘古竟然回答已经教给孙玉一些功法了，但是那只是假象，每次都是盘古利用催眠和药物使她进入一种自己在修炼的感觉，其实只是在她的饭菜里加入了一些超级t病毒基因强化药剂，使她的实力慢慢增长，给她一种修炼有成的感觉而已。
看着面前越来越人性化的盘古，申宫若愚差点说出一句经典台词“高，实在是高”。
这两年来盘古的能力越来越强大，各种新型计算机技术甚至一些理论科技都用在了它的身上，其能力不知道比以前强了多少万倍，虽然它是一个智脑，但是申宫若愚早已经不再把它看做一个工具，而盘古也没有叫他失望，把基地打理的井井有条。
快要走出盘古主机房的申宫若愚停了下来，没有回头的说：“盘古，我们是伙伴吧？我也能够相信你吧？”盘古没有犹豫的回答道“当然，你是我的主人，我的一切都是你给的”“我不是你的主人，我是你的朋友和导师，如果有一天我能登上顶峰，我希望我的身边有你的存在”申宫若愚说着头也不回的用念力将火种源放在了盘古的主机箱前。
“这是什么你应该知道，交给你了，我希望你可以融合它甚至吞噬它，”顿了顿后再次开口说道：“不要叫我失望。”
在解决了孙玉的问题之后，申宫若愚安心的在地里适应自己暴涨的念力，每天没事和孙玉聊聊天，和科学家一起观看一下试验进度，虽然最后老是被人赶出来却依然乐此不疲，或者实验下新的装备，做一下小白鼠以更好的做出适合自己的装备，或者到山谷里欺负一下各种传说中的动物，虽然大部分都只是虚有其表，这时的山谷早就撤掉了当初的三维立体成像仪，一切都如同真正的仙家景象一般。
尤其是驻守在各个山峰之间的“天兵”，各个金盔金甲手拿银枪金盾站立的挺拔如松，这是黄巾力士的升级版，无论力量和反应还有智力都远远超越了黄巾力士，虽然没有感情但是更加忠心耿耿。
其盔甲看似华丽古朴，其实全部是新型艾德曼合金制作的高科技盔甲，成本比天兵本身还高，自带宇宙魔方能量电池供能的防护罩，一般的小型导弹都打不破加上艾德曼合金的坚硬，防御力简直爆表，加上反重力系统和隐秘的推进系统，绝对是绝佳的行星内陆战部队，手中的银枪也是艾德曼合金制成，更能释放出能量射线，如同仙家法力一般，不知道的人绝对看不出有什么不对。
在放孙玉回家解决一些自己的事情，安排了一个最新型的生化机器人保镖陪同她一起回去处理事情，并答应她这里的情况可以有选择的告诉一些自己的亲人，还给了她三个名额之后。
彻底没事干的申宫若愚决定开始再次进入电影，开始收集各种强大的生物样本，在配齐资源还拿了一些冷冻仓之后，申宫若愚消失在了基地的核心区域里面。