南宫派：与前面介绍的南宫宗并非一派，切莫混淆，此处南宫派为全真龙门派支派。由龙门第十代李清秋开启，以广东罗浮山为中心。清梁教无《玄门必读》：“南宫祖李清秋，为龙门第十代孙，得至人传授真道口诀。道成，得证天仙。后秘授曾一贯祖师，法派曰南宫派”。李清秋生平不详。从清陈教友《长春道教源流》卷七可见其传代概况：“曾一贯，号山山，不详何许人。其师李清秋，龙门派第十代孙，得至人传授真诀，一贯传其学，恬修道成，以符药救人。康熙间人罗浮，筑道场于紫霄洞。五十五年（1716），广州旱，当道邀请求雨，雨大注，因委管冲虚观。山中五观，余四曰酥醪，曰九天，曰黄龙，曰白鹤，俱延为住持。后迁紫霄洞道场于酥醪洞，令弟子柯阳桂主之。师自居冲虚，未几羽化。”是为龙门第十一代。其弟子柯桂阳，“号善智，福建泉州府晋江县人。家世住宦，幼习举子业。……弱冠弃家游罗浮，礼曾一贯为师。”与其师共兴酥醪观。“住山三十余年，度弟子百余人。乾隆十年（1745）六月二十日无疾而终，年五十三。”是为龙门第十二代。其后有童复魁，号慵庵，浙江绍兴府会稽县人，为柯桂阳再传弟子，即龙门第十四代。乾隆五十六年（1791）入道于罗浮山酥醪观，时年三十八。复云游二十载，归后被推为酥醪观主持，复被举任道会师之职。嘉庆六年（1801）卒，寿九十八。其徒有江本源，字瀛涛，号松竹山人，广东番禺县人。入道罗浮酥醪观，通儒、释之学，能诗文，士大夫喜与之游。童复魁逝世后，继为酥醪纲住持。为龙门第十五代。又有赖本华，号介生，原名洪禧，字畴叶，广东东莞县人。幼习举业，为诸生，以诗名。后入酥醪观，礼童复魁为师。习静一室，不与人接。年八十余化于观中。有《浮山新志》、《红棉馆诗钞》传世。后有陈铭珪，字友珊，广东东莞人。咸丰二年（1852）副贡生。晚学道于罗浮，派名教友。后修复酥醪观。为该观住持，自号酥醪洞主。为龙门第十七代。光绪七年（1881）卒。传有弟子张永暗等。
金山派：全真道龙门派支派。因发源于山东崂山，又称崂山派。由龙门第四代孙玄清所创。据《玄门必读》等载，孙玄清，字元玉，号金山，又号海岳山人。山东莱州府即墨县崂山人（或谓青州府寿光县人）。自幼在崂山明霞洞出家，礼李显陀为师。后游铁茶山云光洞，遇通源予授以升降天门运筹之法（内丹法）。年十九，即墨县太和真人携住黄石宫，苦炼二十余年，颇有成就。明嘉靖三十七年（1558），至北京白云观坐钵一载，大著灵异。赐号“护国师左赞教主紫阳真人”。卒于降庆三年（1569），寿七十三。1926年北京白云观抄藏之《诸真宗派总簿》记有该派传代派字。传承与活动情况未见记载。
西竺心宗：全真道龙门派支派。由龙门第八代鸡足道者所开启。以云南鸡足山为传播中心。据《金盖心灯》卷六《鸡足道者黄律师传》，鸡足道者，来自月支，休于云南鸡足山。自称野坦婆闭（才字应为者字），华言求道士。所精唯西竺斗法，称“西竺心宗”第一百代。清顺治十六年（1659）赴京师谒王常月，赐姓名曰黄守中，遂为龙门第八代弟子。《觉云本支道统薪传》下卷《闵大宗师传》称，乾隆五十五年（1790）闵一得携王常月所传大戒书去鸡足山，黄守中犹在，闵以大戒授黄，黄以斗法密术授闵一得，闵归而纂为《大梵先天梵音斗咒》十二卷。黄守中所传“西竺心宗”，实为道教中的佛密派，其法多采用道教符箓派的“云篆”和佛教的“真言”，佛密色彩很浓。其徒多为行迹诡异、身挟绝技的江湖奇士。据载，黄守中传管天仙（派名太清），管传金怀怀（王清楚）、白马李，金传活死人（云大辫，本姓王）、李赤脚、石照山人（章大享），活死人传往往生（郭阳晓），为龙门第十二代。黄又传大脚仙、王袖虎。大脚仙传张蓬头，张传龙门道士（郭来澄）和李蓬头等。十二代后传承不详。
云巢派：全真道龙门派支派。由龙门第八代陶守贞开启。以浙江湖州金盖山为传播中心。据《金盖心灯》卷二《靖庵先生墓表》等载，陶守贞，原名然，字浩然；派名守贞，号靖庵。世居浙江会稽，祖唐应蜀藩聘，遂居蜀。幼孤，随母居蜀。母卒，至浙江吴兴依族侄陶思萱，寻入金盖山修道。清顺治十五年（1658年），受戒于北京白云观王常月，授以卷册，遣归金盖。康熙十二年（1673）卒。传法给族侄陶思萱（号石庵），为龙门第九代。陶传第十代徐清澄（号紫垣），徐传第十一代徐一返（号隆岩）。一返兼承正一派，法名汉臣。“祷雨祈晴，无不立应”。沈一炳弟子龙门第十二代陈阳复（号樵云）亦曾得徐一返授正一法。其该派分衍为更小支派，传衍于江浙。
天柱观派：全真道龙门派支派。由龙门第八代金筑老人开启。以浙江余杭金筑坪天柱观为传道中心。《金盖心灯》卷二《金筑老人传》：金筑老人者，“字号三见而三异：《洞霄闻人志》载，盛青崖，江南桐城人，明末进士，隐天柱观；《杨氏逸林》载，樵云氏者，桐乡人，姓盛，名未详。明末进士，值世沧桑，高隐大涤，自号退密山人。《菰城拾遗》载，异人金大涤，学富五车，尝自比管、乐。明亡遂隐，初休金盖山之白云居，更号樵云，既归老于天柱金筑坪。……著作颇多，石庵辈梓以行世。”盖为清初一隐君子。曾从王常月受戒，为龙门派第八代弟子。康熙三年（1664）传潘太牧（字牧心），为龙门第九代，潘传第十代王清虚（号洞阳），王传第十一代潘一元（字天崖）。此后承传不详。
金鼓洞派：全真道龙门派支派。由龙门派第九代周太朗开启。传播中心在杭州金鼓洞。据《金盖心灯》和《金鼓洞志》载：周太朗（1628—1711），字元真，号明阳，江苏震泽（今吴县）人。父殁，舍俗出家。初礼龙门第八代孙守一（号玉阳），继礼黄守元（号赤阳）为师，嗣为龙门第九代。后游东南，于康熙三年（1664）来杭州。康熙五年（1666）结茅于西湖栖霞岭北金鼓洞，建屋修真，即后之鹤林道院。于是参玄访道者云集。先后传弟子戴清源（号初阳）、高清昱（字东篱）、方清复（号凝阳）、谢清涵（号宾阳）、金清来（号静灵）、孟清晃（号逸阳）、许清阳等。闵一得云：“当时从师（指周太朗）者，千有余人。闻之轻云子（指沈一炳）曰：全真一派，东华而下，盛自重阳（王囗），历传丘（处机）、赵（道坚）、陈（通微）、周（玄朴）祖，周传张（静定）、赵（真嵩）、王（常月）、黄（守元），……逮我明阳子周律师出，祖道南行。”与诸师“赓扬唱和。玄风庆会，自元而降，殆无有过之者。”（《金盖心灯》卷三《周明阳律师传》）表明龙门派南传后，以周太朗时期为最盛。周太朗弟子中，高清昱去浙江天台山，另开桐柏宫支派。其余住山弟子继续在金鼓山传衍。戴清源传第十一代骆一中（字圣哲），骆传第十二代蔡阳善（字天一），蔡传第十三代戴北庄（派名戴来某），戴传张复纯。时当清道光年间。
桐柏宫派：全真道龙门派支派。由龙门第十代高清昱开创。以浙江天台山桐柏宫（崇道观）为传播中心。据《金盖心灯》卷四《高东篱宗师传》：高清昱，字东篱，祖籍山东宁海州（治牟平），寄居长白。宿学儒。康熙三十一年（1692），年已七十五，始由台湾至浙江杭州金鼓洞，师事金鼓洞派创始者周太朗（号明阳），嗣为龙门第十代弟子。周授以《南华》、《道德》、《参同》、《悟真》、《华严》、赵注《大学》、《中庸》及《心经》等。居金鼓洞鹤林道院四十余年，从游者众。雍正十三年（1735），出主天台桐柏山崇道观讲席，后启桐柏宫支派。乾隆三十三年（1768）卒。著有《台湾风俗考》三卷。高清昱传弟子沈一炳（号轻云）、方一定（字熔阳）、闵一得（号懒云），为龙门第十一代。沈一炳传弟子陈阳复（字云樵）、周阳本（字梯霞）、费阳得（字丹心），为龙门第十二代。他们又多开启更小的支派。陈复阳开启余杭南湖三元宫支派，门下有阮来宗、杨来逸、钱来玉、鲍来金等；周阳本开启余杭铜山半持庵支派；费阳得开启归安（吴县）射村开化院支派。方一定下传弟子十二代顾阳昆（字苍州），顾传十三代王来真（号峄阳），开启苏州裴嫁桥斗母宫支派。闵一得下传弟子也很多，其徒孙辈王来因等又宗祖他开启觉云支派。他本人学综三教，著述甚丰，是清代少有的著名道教学者。