回到圣芙蕾雅学园的各位，自然需要好好休整一番，布洛妮娅在醒来之后知道自己被带了那么长一段路还浑不自知，自闭了整整半个月。
望眼欲穿的初月终于将宇智波风吾等了回来，德丽莎算了算时间，从他出去久布洛妮娅再到回来，撑死也不过才一天而已。敢情这样是离得久了，她非得发疯不可。
倒是处在宇智波风吾精神空间的辉夜姬，在回来的路上听了宇智波风吾那一席话之后，一直保持着沉默。
至于宇智波风吾，也并没有因为回到圣芙蕾雅学园就放松警惕。作为以前在孤儿院的同伴，现在与自己敌对的适能者，经此一役，张天修肯定将自己当成了眼中钉，以后若是再遇上，战斗肯定是免不了的。
"德丽莎，麻烦你把有关灰暗世界组织的所有资料给我。"这天，虚心的舰长拜托学园长德丽莎·阿波卡利斯送来了大部分机密的资料，花了整整三天的时间，才将灰暗世界这个组织的资料完完整整地过了一遍。
灰暗世界，在这个世界，是天命一直以来的死对头，从远古时期的女武神开始，就有了和他们的交战记录。
他们成立之初利用崩坏能改造生物的身体，给整个世界带来了无穷无尽的灾难，圣芙蕾雅学园被他们盯上也有好长一段时间了，而他们的理由也非常简单，在琪亚娜·卡斯兰娜体内存在着空之律者西琳的基因，他们希望得到琪亚娜·卡斯兰娜壮大自己的队伍。
灰暗世界组织的成员经常伪装自己，潜入民间，展开一些不为人知的活动。天命曾发现他们与一桩失踪案有关，通过深入调查，才知道他们当时正在进行一个人体改造实验。遗憾的是，那个失踪的女孩子并没有活下来，她死在了实验中，灰暗组织为了抹消痕迹，将实验室毁了一通，好在天命在调查的时候发现了一些蛛丝马迹，特意委托天命的女武神暗中调查，德丽莎当时也接到了这样的命令。
自从圣芙蕾雅学园的舰长失踪之后，天命的行事就变得低调了起来，有人说那是因为天命的主教奥托·阿波卡利斯太过宠溺自己的孙女德丽莎·阿波卡利斯，知道学园的舰长突然失踪对她来说打击很大，为了配合她们的行动，所以他把大部分的力量都用在了找人身上，所以与灰暗世界组织的战斗也就缓了下来。灰暗世界组织虽手段残忍，深不可测，但对天命也有所忌惮，既然天命不找他们麻烦，那么他们肯定不会做打草惊蛇的蠢事。
另一种说法是，这位新任的休伯利安舰长有着通天的威能，天命之所以将大部分精力放在寻找他的身上，也是因为这方面的原因，找到了休伯利安的舰长，他们对灰暗世界组织的作战才能万无一失。
不过有一件令宇智波风吾颇为在意的时候，这个"舰长"的活动也是从那个时候开始的，他拥有匪夷所思的力量，在转瞬之间就改变了战局。而且根据德丽莎她们的描述，那完全就是另一个自己，这反而让宇智波风吾一头雾水，他还以为自己失忆了，经过辉夜姬和多多的检查，自己确实是健健康康的，这才让他松了一口气，因而这件事情也就成了一个谜。
一个月的时间，卡莲和八重樱终于养好了身子，上一次战斗留下的伤口也痊愈了。闭关多日的多多并没有宇智波风吾想的那么情况严重，按照多多的说法，它试图连接第三秘境的***，查询一些资料，这个过程虽然遇到了不少麻烦，好在最后成功了，也不算白费时间。
因为宇智波风吾击败了目的混乱的第三秘境意志体，所以第三秘境也被他攻略了。自那之后，第三秘境对宇智波风吾就一直是永久开放的状态。他可以无条件取用第三秘境的金晶石，畅通无阻地进入试练塔查询资料。但这种权限仅限他一人，即便是他有心让多多查阅，原则上多多作为未被承认的存在，是不具备查阅的资格的，无奈之下，它只能依靠自己来暗箱操作了。
"话说，舰长为什么要让大家****，难道你不觉得这样太散漫了吗？"一直努力想成为S级女武神的琪亚娜自然不愿意将大把时间浪费在上街散步上，实际上是因为她早上刚刚玩好，现在继续的话总感觉对不起自己的良心。
"哦？早上我可是看得清清楚楚......"宇智波风吾稍稍偏过头，斜视着身后紧握双拳的琪亚娜，别以为你做了什么我不知道。然而下一秒，在知道自己即将露馅的时候，以迅雷不及掩耳之势捂住了宇智波风吾的嘴巴！
"舰长，不要说出来啊！"琪亚娜声音很小，刚好她和宇智波风吾走在队伍的最后边，所以并没有被前面的一行人听到。而且两个人反应迅速，在她们回头之前就分开了，所以并没有被她们发现异常。
"德丽莎，你把琪亚娜带上，帮她买些衣物。"到了商业街，又是女孩子最喜欢的购物时间，八重樱和卡莲一到地**呼都不打便离开了，初月虽然想和宇智波风吾一起逛街，但是姬子根本不放她走，只能泪眼汪汪地无奈离开，而且还是被姬子拖走的。经宇智波风吾这么一提醒，德丽莎想了起来，琪亚娜确实好久没有换衣服了，所以也没管琪亚娜愿不愿意，她就将琪亚娜拽走了。
"舰长，那我们三个一起去逛吧？"
"不了，你们女孩子家买东西，我就在四处转转，等着你们吧。"
原本令宇智波风吾担心的布洛妮娅，却和芽衣相处得出奇的好，这也让他心里的大石头落了下来。
现在众人都各忙各的了，圣芙蕾雅学园也基本上没什么人在，他回去的话，就可以好好招待一下这个不速之客了。虽说这样做有些对不起她们，但是没办法，不能让她们置身险地。
因为这个敌人，可不好对付。