在丰云山威胁终止和议、来年再战的情况下，爱新觉罗·巴尔堪请示清廷议政会议同意，遂于明弘光十八年（清兴泰元年、西历1662年）九月初一代表满清政府与大明正式签署了《喀拉库尔和约》。
《喀拉库尔和约》一共七条内容：
第一，
满清随后将国号改回后金，兴泰皇帝福全去帝号，改称汗王，并向大明皇帝称侄，此外，后金还要将亲王等宗室爵位降等（实际是将亲王、贝勒两爵降为贝勒、贝子），以便后续与大明交往中不至于僭越；
第二，
后金多罗康贝勒爱新觉罗·玄烨将前往大明国子监游学；后金固山贝子爱新觉罗·常阿岱将作为告罪使陪同玄烨一起前往南京；
第三，
大明与后金约定，双方以喀拉库尔湖以西二百四十里处为两国边界线，稍后两国将联合进行边界踏勘，各自树立主权界碑；
第四，
两国将在边境线某个合适的位置设立榷场，进行互市，并商定具体的互市细则及贸易纠纷处理办法；
第五，
后金为万历朝以下给大明造成的损失，向大明赔偿黄金六万五千两、白银二百十七万两、马驼二千六百匹、奴隶八百人；
第六，
禁止后金以武力入侵大明之藩属，后金与大明藩属国家之间的争议，将由大明负责裁定，而大明的裁定即为最终裁决，对后金及与后金发生冲突的大明藩属国具有绝对约束力；另外，在后金与其他非大明藩属国家冲突时，大明将保持善意中立，不向冲突中的任何一方提供任何性质的帮助，也不向其中一方出售军械、马匹、粮食、药物等军用物资；
第七，
在后金履行了本和约之第一、二、三、五项后，明军将部分撤出在昆坚地（后金称呼唐努乌梁海）的驻军。
和约虽然最终由双方代表落笔签署了，不过因为时间已经进入九月，雪期即将来临，道路通行不便，物资运输困难，所以，明清双方谈判代表在各自请示了高层后，决定玄烨、常阿岱将在明年春季雪化后起行，而后金赔偿给大明的黄金白银马骡等也将玄烨出发的同时，移交给大明方面。
《喀拉库尔和约》的签署及稍后的履行，宣告了自爱新觉罗·努尔哈赤发布《七大恨》以来，建州与大明长达四十二年的恩恩怨怨暂时告以段落；但这份和约其实是停战书，而非和解书，所以，在若干年以后，双方的战火还会重新燃烧起来。
不过那时已经是朱和塽的时代了，并且那场大战还不仅仅是明清两国在做最后清算，和硕特、准格尔、哈萨克、罗刹等国几乎全部卷了进来，以至于那场战争被更后来的人们称为东方的三十年战争，可这就是后话了······
啥？杨存孝部全部后撤了，昆坚行都司的防御移交给谁？
明廷就不怕满清前脚签约，后脚就撕毁条约吗？
另外，杨存孝部撤退了，朱由崧计划夺取叶尼塞河以东的作战，由哪一部来执行呢？
不会就此搁置吧？
要知道，算到明年开春，杨存孝部在北庭、昆坚作战生活的时间已经超过两年了，可以说上上下下都已经十分疲倦了，的确应该让他们撤回关内修整了。
至于杨存孝部撤回后，昆坚行都司的防御嘛，完全可以交给杨存孝在今年组建的昆坚勇士营各部来负责。
什么？昆坚勇士营是以八旗降人为基础组建的，政治上未必可信！
你这是老眼光了，没错，昆坚勇士营第一个团的确是用愿意留在昆坚生活的京营老兵及八旗降人组建的，但在今年开春后，根据朱由崧的指示，明廷从铁勒行都司、定襄（林北）都司迁入了相当数量的布里亚特蒙古部族，然后将这些布里亚特蒙古部族与八旗降人打散后重组了昆坚境内的各卫所----共编成六卫七独立千户所----并从新组建的卫所中抽兵重建了昆坚勇士营所部，因此目前总兵力3个团的昆坚勇士营在政治上已经相当可靠了，并不会出现清兵杀来就再度倒戈的情况。
此外，弘光十八年中，杨存孝部除了夺取了喀拉库尔以外，还在清军可能潜越的鄂尔噶汗山各条谷道中建设了十数个扼险而守的堡砦，这些堡砦虽然驻军不多，但也足以挡住清军的第一波攻击，从而能让后方有足够的预警和避让时间、求援时间。
等到大明的勘界使臣接收了喀拉库尔泊以西120公里的山区后，昆坚勇士营还会在西面设置更多的哨砦、堡砦，并禁止后金的商队在榷场以外贸易，因此日后清军想要卷土重来，再度杀入唐努乌梁海地区的话，不说不可能吧，至少难度会很大，远不如其绕过萨彦岭-阿尔泰山，杀入额尔齐斯河上游更为容易。
再有就是，杨存孝部撤离昆坚的时间是在清廷移交人质和赔款之后，姑且不说清廷送来的人质的真假，可金银实物是不可能做假的，既然清廷花了那么大的代价，又怎么可能短期内就撕毁和约呢？
至于天长日久之后，就算满清毁约了，袭击昆坚地的可能也不大，毕竟昆坚面积有限、能养活的人口也有限，清军冲进来也是抢不到什么的，还会遭到来自丁零、铁勒、燕然、瀚海等地的援军的反击，结果很可能是得不偿失。
所以，即便杨存孝部撤离了，因为地形限制的缘故，昆坚地的安全还是有基本保障的；而明军未来对叶尼塞河以东俄国占领区的进攻嘛，朱由崧完全可以重新调遣军队的，是的，不从昆坚走，因为这会拉长了补给线，增加后方运输压力。
对的，到时候明军将从铁勒方向发起进攻，然后沿着昂嘎拉河（安加拉河）前进，这样就能充分利用昂嘎拉河的水运来减少运输损耗了----俄国人当年也是沿着水路一路东进的，如此先进的经验，明廷自然要学习和照抄的。