由于吕宋战事刚刚结束不久，明军内洋、东洋、南洋、琼海四路水师的主力目前尚且驻扎在吕宋境内，所以明廷通过无线电下达军令还是很快能将其等调往东印度群岛前线的，无非是软帆船队南下速度更快一些抵达勿里洞岛以东海域待命，淮丙船队却需要更长的航行时间，也许就会赶不上趟了，但无论如何，水师的调动要比向战区增派陆师方便了太多。
没错，因为吕宋各岛上仍有少量西班牙人遁入丛林负隅顽抗，且大量土著也不顺从大明的统治、所谓邢藩兵马及南长诸藩兵马也没有能编成并开往吕宋诸岛接防，因此参加吕宋作战的各支部队很难立刻从吕宋各岛的镇戎任务中脱身，仅有南洋水师陆战旅一支兵马勉强可以抽调出来归建----但也因为乘坐的是淮乙船、一般福船的缘故，归建的速度并不快，与淮丙船队一样，有可能来不及赶上敌人的第一波攻击----就只能由明廷从国内另行调用兵马南援，可从国内调集陆师坐船千里南下参战可不是那么容易的事情，光一个运输时间就让人窒息，委实很难在荷军发起进攻前布置到位；如此一来，南洋方向在战争一开始的阶段，就不得不在水战陆战两方面都以弱敌强了。
是的，由于西厂落实荷军来袭情报的时间是在荷军进驻锡兰休整三个月后，所以，期间荷军已经基本完成了包括招募印度雇佣兵、后勤兵在内的对明开战的一应准备，因此，荷军并没有给明军从容调度的时间，在明军水师接令南下后没几天就扬帆起航，从锡兰直扑东印度群岛而来了----在距离母国2万多公里外维持一支的数万人海陆军，是需要消耗天文数字的资金的，荷兰人虽然是当世欧洲第一经济强国，但也显然无法如此挥霍，故而，一旦部队休整完毕、作战准备完成，荷军便迫不及待的发起了总攻。
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舰队浩浩荡荡的离开锡兰后，很快抵达了阿镇外海，在这里荷军进行了分兵。
荷军指挥官威特·德·威斯将军将所属舰队分成了3队：
第1舰队由4艘葡萄牙武装商船、12艘荷兰武装商船、12艘英国武装商船组成，这些武装商船与另外2艘荷兰双桅信报船护卫着包括欧洲运输船、阿拉伯桨帆船、东非穆泰普船(mtepe)、印度古吉拉特拿屋船（naos，又叫圆底船）、锡兰yatradhoni船、中式戎克船在内的60艘运输及船上4000名荷军-印度雇佣兵的前往帝汶岛，该舰队将负责收复古邦和帝力，然后共同深入香料群岛海域，袭击往来中国船只并尝试攻打安汶；
第2舰队由34艘荷兰船----其中有4艘装备52门火炮的三*级战列舰（注：欧洲三*级战列舰的标准是载炮64~74门，但荷兰三*级舰吨位和载炮数量都较少，不过荷兰三*级战列舰所载火炮通常为42磅和32磅炮，火力相当猛烈）及8艘32~48炮巡航舰、20艘装炮20~30门间的武装商船、2艘双桅信报船----2艘法国船、2艘丹麦船、1艘马耳他船、1艘库尔兰船、1艘瑞典船组成，这些战船及另外3艘荷兰信报船护送着80余艘运输船及7000余名荷兰陆军-印度雇佣兵准备经由巽他海峡直扑巴达维亚；
第3舰队也是荷军的主力舰队，由97艘荷兰战船、荷兰武装商船和4艘双桅信报船组成，内中有包括11艘三*级战列舰、23艘巡航舰在内的34艘标准海军战船，以上这些荷兰战船护送着另外170艘运输船及船上18000余名陆师官兵进入马六甲海峡，然后会首先收复了马六甲港，再水陆并进，攻击龙牙门岛及周边岛屿······
明弘光十二年、西历1656年九月十一日，荷军第3舰队浩浩荡荡的驶入马六甲港外海，并于同日进行了对陆炮击及小艇登陆作战。
见到荷兰舰队铺满整个马六甲港外海，海量的荷兰陆军涌上陆地，柔佛苏丹根本不敢调兵迎战，于是在荷兰舰炮向马六甲陆地倾泻炮火的第一时间，便向内陆逃去，因此，荷兰人可以说兵不血刃的就占领了马六甲港。
占领了马六甲港后，荷军一面在港口重置炮台、要塞，一面又迅速扫荡周边地区，从土著口中抢夺粮秣、马匹，并随后以主力沿海岸线开往柔佛。
不过鉴于明军在夺取马六甲港及巴达维亚过程中表现出来的惊人战斗力，荷军陆师不敢轻易脱离舰炮的掩护，而受到行动相对缓慢的荷军陆师的牵累，荷军第3舰队只能亦步亦趋，未能迅速以主力扑向龙牙门一线。
相比相对缓慢的第3舰队，荷军第2舰队的行动速度就快了许多，当年九月十三日，该舰队便抵达了赛尔通岛以西地区，并在第二天上午07：00后，全力冲向桑吉尔岛东北的巽他海峡出口。
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荷军第2舰队发起进攻时，明军陆师根本没有来得及开到桑吉尔岛，因此在桑吉尔岛建设炮台阻敌的计划彻底化为了泡影----其实朱由崧原本也没打算真正在桑吉尔岛建设炮台，只不过希望通过某些渠道让荷兰人产生畏惧迟疑心理，以便明军后续行动，但很显然，朱由崧的计划是失败了，荷兰人自持力量强大，不管不顾的实施了强行闯过巽他海峡的方案----并且此时，朱由崧计划布置在巽他海峡入口处阻敌的30艘淮丙船中的26艘尚在途中，显然是来不及赶到并阻止荷军舰队冲入爪哇海了。
面对气势汹汹的荷兰舰队，明军仅有的4艘淮丙船拼死进行了一番抵抗，虽然明军拥有火炮质量上的优势，但4:41，其中对手还有12艘专业海军军舰的情况下，明军的抵抗只能是螳臂当车，最终，4艘淮丙舰在敌军炮火的围殴下，伤痕累累，就只能心不甘情不愿的在获得了击毁、重创敌军战舰3艘的情况下，退往苏门答腊东南角的吉打邦近海沙洲地区，并最后搁浅在沙洲上。
为了确保前装线膛炮的秘密不被荷兰人所掌握，4艘明军淮丙船上官兵含泪烧毁了自己的军舰，然后逃入苏门答腊岛暂避······