虽然因为地形的缘故，不能大打出手，但摆脱了郧阳这个包袱后的孙传庭并不甘心只是在归州以西堵住顺军出川之路，于是孙传庭便请旨西进，在得到朱由崧批准后，孙传庭便制定了一个三路合击的作战方案。
根据这个作战方案，孙传庭以主力15000人在夷陵水师黄蜚部14000人的配合下，溯江而上，进攻巴东、巫山；北路军5000人自陆路经由高岚-峡口-仓坪-白湾-沿渡河-楚阳-关坪-两坪一线逼近巫山县城；长江以南的南路军4000人（主力为湘西土兵）同样一路翻山越岭，自陆路西进，迫向巴东。
面对孙传庭的进攻，已经将所部兵力扩充为万人的袁宗第、辛思忠部利用地形进行了顽强抵抗，但由于兵力太少，因此在南北两路陆师包抄夹击下，不得不陆续放弃了巴东、巫山两县，把队伍撤到了奉节，并试图依托瞿塘关和夔州府城，对孙传庭部展开阻击。
由于在进攻巴东、巫山时消耗了大量的粮秣辎重，所以，夺取了巫山后，孙传庭部失去了继续向奉节一线进攻的动能，只能转而沿着大宁河北上，分别收复了大昌、大宁两县，然后再次转入防守状态；由此，明顺两军便在瞿塘峡形成了新一轮的对峙······
明弘光二年三月十七日，济州水师一部将打着【皇明登莱巡按铁】、【左军都督府同知、济州水师总兵官、平波将军宁】旗号的京营新设立的勇士营一部，计一团兵马送上了威海湾海滩，对之前投清的威海卫城造成了威胁。
虽然明军只有一个团1200余人，但由于威海卫守军大多对明朝怀有感情，因此威海卫指挥使李奕、张先臣，指挥使同知胡长春、叶翼德、丁褒忠，指挥使佥事贺勋臣，千户贾天扬、王阁臣、邓有年等在确认当面部队的确由新任登莱巡按铁存法统帅后，便杀死亲附清廷的掌卫官沙行武、驱逐了其他几名同意更看好清廷的威海卫高层，率部反正。
而在李奕等人的带领下，威海卫麾下的金山备御左千户所、百尺崖备御后千户所及成山卫名下的寻山备御后千户所，相继易帜，再次回归了大明的统治。
得到威海卫及周边千户所反正的消息，清宁海州知州及投降清廷的宁海卫高层望风而逃，宁海州就此不战而落入了明军之手。
在得到宁海州易手的消息后，成山卫卫城、靖海卫卫城、大嵩卫卫城及宁津守御千户所、海阳守御千户所等周边卫所及文登县、福山县等地也纷纷宣布反正，由此，整个胶东半岛就在短短的十天内，重新变成了大明的领地。
但实际负责此次攻势的宁虎却知道，这种现象不过是昙花一现，所以，他一面命令勇士营第十七战兵团团长于通对赶来共襄盛举（凑热闹及骗粮饷）的各部反清武装进行整编和强化训练，另一方面并未固守宁海州城，而是想办法调动本地人力，在威海卫建设棱堡化要塞，以应对清军可能的反扑。
领悟了宁虎的意图后，于通在抽调各地归附武装中精锐兵源----并非所有人都愿意把手中最能打的兵交出来的，所以期间少不了威逼利诱以及各种交换----的同时，一并把挑捡下来的兵马编成了勇士营第十八至第二十二辅兵团。
然后，于通便命令这兵力5个不等的团----兵力多的团拥有小3000兵马，兵力少的团仅有800人出头----大张旗鼓的向登州府城及尚未易帜的栖霞、黄县、莱阳、招远等县进军，以进一步扩大声势，牵制清军可能对威海方向的反击。
当然，登州府城是没有那么容易被攻下的，这不，登州周边的清军在得到宁海州发出的警报后，纷纷退到了登州府城和比邻的登州水城坚守，一时间，倒也齐聚了近4000多清军，但这些清军的战力薄弱，跟前来攻击的明军勇士营第二十二辅兵团那2800鱼腩倒是棋逢对手，所以，在麻杆打狼两头怕的情况，双方于登州城下形成了对峙状态。
但清军把黄县等地的防御力量撤走之后，栖霞等县面对进击中的明军勇士营第十八辅兵团等部就毫无防御能力了，因此，这些县城在短短数天内边很快落入了明军勇士营新编各部手中。
夺取了上述县城后，根据宁虎和于通的进一步指示，勇士营第十八团等部或多或少的向威海要塞派遣了一些当地劳工，接着，总兵力已经膨胀到了2万余人的4个勇士营辅兵团，在于通的强逼及时任登莱巡按铁存法的利诱下，不得不离开新占据的地盘，继续向莱州展开进攻，似乎准备一路平推，直接杀到济南城下。
得到明军10万大军向莱州城攻去的消息，正在青州镇压当地反清武装的耿仲明只能暂时停止对青州地方武装的的进攻，带着部下火速驰援莱州，并在平度城下一举击败了勇士营第十八辅兵团所部5000余人。
因为在此战中抓了大约3000多俘虏，觉得带俘虏上路太过麻烦的耿仲明就下达了屠杀令，将3000多明军俘虏全部屠杀一净······
随后，从平度“百姓”处获得一定补给的耿仲明，马不停蹄的率部直扑莱州城，并在莱州城下与莱州城内清军里应外合，击败了勇士营另外3个辅兵团，杀死围城明军官兵1700余人，俘虏了另外4000人。
故技重施的耿仲明又在莱州城下上演了大*屠杀的一幕，这才得意洋洋的率着所部东去救援登州。
被耿仲明击败的4个辅兵团实际属于山东本土反清武装，因此在遭到灭顶之灾后，大家伙想的都是逃回老家，而不是通知登州城下的勇士营第二十二辅兵团所部，所以勇士营第二十二辅兵团根本就不知道己方已经大败特败了，还傻乎乎的在登州城下待着，结果被耿仲明部的奇袭一下子打懵了，最终与其他4个辅兵团一样，被耿仲明部切瓜砍菜一般打了个落花流水······