消灭了冲入己方阵营中的满八旗精骑后，羽林营正军师官兵迅速重组队形，然后向前疾行十多步，然后随着实际指挥战斗的本师第一旅旅长张良相（泉水观下院军校一期生）的命令，向左右旋转，然后用排铳开始驱逐还在骚扰两个辅军师的蒙八旗骑兵。
咦？为什么两翼的辅助骑兵不出手，非要羽林营正军师主力出马驱逐蒙八旗骑兵呢？
原因也不复杂，首先从福王府时代开始，朱由崧手下就少合格的骑兵，如今还不容易培养出8个辅助骑兵团来，按每团170战兵计算，也不过1400骑而已，怎么可能拿来跟清军对耗呢？
其次，就算要对耗，单个辅助骑兵团直面的可是近自己2倍的敌人，辅助骑兵们又不能逆天，如何能以一敌二呢？
所以，辅助骑兵便从一开始就下马持铳步射，籍此为2个辅军师主力提供一定的火力支援，但由于单团战兵数量太少，进而导致了齐射或狙射效果有限，不能完全压制来去如风的蒙八旗轻骑兵，因此，最终要动用羽林营正军师出手----当然，羽林营正军师出手能让己方阵线的混乱看上去更真实一些，从而诱使清军主帅进一步误判。
2720杆前装线膛枪齐射的威力果然不俗，当即就把还有所想法尼堪、何洛会两位领兵的满洲指挥官给镇压了，其中尼堪连同他手下100多蒙八旗兵直接被铳弹给打死了，而何洛会虽然死里逃生，但手臂上中了一枪，也彻底失去了战斗力，只能勉强的率领80多残骑逃了回去。
又给正在回逃的蒙八旗轻骑兵安排了一顿齐射后，羽林营正军师的官兵听从指挥，迅速返回原来的阵线重新排列，但这种行为在远远观察明军动向的多铎等人看来就是愈发混乱的表现，于是，在多铎的催促下，6000清军步卒便火急火燎的向明军展开了全面的冲锋。
其实6000步卒只是多铎安排的第一阵，在第一阵后，多铎又安排了4000步卒和2000骑兵作为第二阵，于间隔50弹指（每弹指7.2秒）后出阵向明军战线攻击而去----由于之前夺取定远、来安都没有损失兵力，因此马汊河大战爆发时，多铎手中还有26000多兵马，再扣掉刚刚损失的600多新附军和800多满蒙八旗兵，以及作为辅军伙兵的2000余人，多铎还可以向战场投入22000余兵力，但多铎也不敢做一锤子买卖，所以，还留下了10000多兵马作为总预备队。
由于明军控制了位于马汊河边的几个小山丘，因此，对于清军的动向，明军看得一清二楚，所以，一开始，除了中央战线的羽林营正军师战兵部队及两翼辅助骑兵依旧使用远射程的前装线膛枪对第一阵清军实施打击外，并没有动用炮兵部队。
直到清军第二阵的6000人，全部进入明军炮兵的有效射程后，32门明军大炮这才亮出了自己的“金嗓子”。
羽林营一共装备三种火炮：即营属攻城炮团的40斤攻城炮，正军师下属各旅炮队装备的1寸半（51mm）前装线膛炮，以及正军师师属炮团装备的1寸半前装线膛炮和2寸（68mm）前装线膛炮。
但由于40斤攻城炮放列重量超过3吨，非常不方便运输，所以，这次就全留在了南京城内；实际参战的是放列全重975公斤的1寸半前装线膛炮和放列全重1456公斤的2寸前装线膛炮；前者的有效射程1235米、最大射程1721米，后者的有效射程1566米、最大射程2177米；前者发射的爆炸弹杀伤半径为3~4米，后者发射的爆炸弹杀伤半径5米左右。
突如其来的炮击让第二阵清军顿时有些不知所措----没错，不懂三角函数和弹道学的清军根本不清楚为什么己方的第一阵出击部队没有挨到炮击，偏偏是第二阵部队遭了殃----然而这一发呆就倒大霉了，要知道第二阵清军今天遇到的不是动静很大，杀伤效果却很差的实心弹，而是在半空中就会爆炸、然后泼洒出阵阵铁雨的爆炸弹。
说实在的，由于距离相对较远，且炮手中新兵太多，所以，羽林营炮兵部队的射速根本没有达到日常训练每分钟4发的要求，仅能保证每分钟2~3发而已，而且一开始炮弹落地并不准确，所以炮击了一段时间后，明军炮火才逐渐打准了。
然而饶是如此，明军发射的爆炸弹，还是给清军第二阵造成了空前的灾难，至少35%的出阵清军都横死在可怕的钢铁风暴中，至于剩下的若是没有吓傻的话，全都一哄而散了。
在第二阵清军被炮火击溃的同时，第一阵清军也没讨得好了。
这不，由于之前连续用线膛枪击败清军步兵和骑兵，精神大振的羽林营正军师的新兵们的心态越来越好了，这就导致了羽林营正军师各部战兵的装填速度有显著提升，进而每分钟内齐射速度也得到了增加，如此一来，就使得清军第一阵承受的压力，随着他们不断逼近明军战线而越来越大。
前方，本部中最精锐者一排排的倒下，后方，又传来的连珠般不详的爆炸声，顿时让很多新附军官兵感到了不妙，因此第一阵清军中不少人开始脱队逃跑了，并且随着时间的推移及己方伤亡的增加，转身逃跑或装死的清军越来越多，最终导致清军第一阵的进攻，就此自行瓦解。
判定两阵清军崩溃后，清军已经失去主动进攻能力，极有可能立刻逃窜的羽林营参谋小组及时的向张茂德建议发起全线进攻，张茂德火速向朱由崧做了报告。
“如此说，大局已定了？”看着面前的张茂德及杨存孝等人，朱由崧轻笑道。“那就展开反击吧！”
张茂德领了朱由崧的旨意，当即命令道：“重甲兵留守保卫炮兵、工兵和陛下，其余各部立刻发起反击！”
朱由崧想了想，起身来到军鼓前，伸手从力士手中接过鼓槌，然后在张茂德的示意下，重重的敲响了军鼓，与此同时，原本的监国亲王旗被降了下来，一面代表朱由崧的皇帝大旗重新升了上去。
注意到敲击进军鼓的身影----朱由崧特意穿了皇袍----和新出现的皇帝大纛，参战明军各部顿时山呼海啸起来，随即，这些士气爆棚的明军开始向清军反推了过去。