张思远安排留下来的中尉和少尉军官们讨论，最后陆军和炮兵，骑兵的事情解决了，俘虏们也有专门的负责中尉管理，他的责任就是重建二级辅助舰队，他的舰队。
二级辅助舰队，所有舰长都要求至少是少尉，一些战舰，要中尉，这些中尉从留下来的伤员里面选择，这些伤员都有十分深的战功，而且有作战经验。
现在他们的战舰没有一艘好的，只能尽量挑选那些经过简单修理以后能使用的战舰，当然三四天能修理好的战舰早被吕方带走了，充作新定阳州巴拿马舰队的辅助舰队了，留下的那些战舰都经过十几天的简单修理才修好的。
目前他手里只有一艘受伤不太重的中伤巡洋舰，这也是唯一一艘比较突出的战舰，经过更换那些其他重伤的巡洋舰上的舰炮，炮塔，经过简单的敲敲打打，战舰看起来坑坑洼洼的，并且速度也只有十九节，可也不错了，至少火力恢复了，防御力下降到了原来的七成，速度下降到原来的七成。
要知道巡洋舰是以巡航的距离远和速度快著称的，原先可是能巡航八千多海里，一万多公里，现在巡航的里程即便不足也能达到六千多海里，速度达到了最快十九节，巡航速度十节，十六节速度能到达亚速群岛，这里到亚速群岛可是四千多海里呢。
一艘巡洋舰，这次作战中成绩比较厉害的一名中尉担任巡洋舰代理舰长，也是旗舰舰长，剩下的三名中尉是三艘经过十几天修理的三艘驱逐舰的舰长，然后是缴获英国人的一代战舰，这些只比改进型铁甲舰四型战舰稍微差一些的七艘战舰经过二十多天的修理，也终于入役了，七名战功赫赫的受伤的伤势基本上痊愈的少尉担任舰长，这些战舰也命名为驱逐舰，这下他拥有了十艘主力战舰，一艘旗舰。
还有两艘伤势较重的护卫舰将在三十天以后入役，到时候又有两名中尉伤势痊愈，于是他的舰队里面就有了总共十三艘主力战舰了。
而圣胡安的包子少尉，他率领的是三级辅助舰队，他那里拥有一艘三型驱逐舰，那艘状态还可以，经过了一个星期的修理就入役了，那是他的旗舰，他手下有八艘缴获敌人的准铁甲舰，那种木头壳子，外面包裹铁皮，中心龙骨使用钢铁制造，肋骨也是钢铁制造的准铁甲舰，类似华夏帝国以前的蒸汽机战舰，只不过火力上不小，装备了英国人的四门90毫米口径火炮。
这八艘准铁甲舰就用准铁甲舰命名，上面是八名立功的军士长担任舰长，剩下的还有二十艘商船，是武装商船，也是负伤的，经过修理以后能使用的，上面装备了两门敌人的七十五毫米火炮，四门五十毫米他们的速射炮，这是三级辅助舰队的全部战舰。
九艘战舰，二十艘武装商船，武装商船既可以作为登陆部队的运兵船，也可以作为他的二级辅助舰队的物资补给舰队，还可以担任侦察和巡逻。
不过作为二级辅助舰队他下面可以拥有两只三级辅助舰队，他重新建立了一个值侦察舰队，侦察舰队有俘虏的敌人一艘千吨铁甲舰，还有一艘伪装的一型铁甲舰，另外还找了二十艘速度快的缴获敌人的蒸汽机战舰或者小型吨位的商船，担任他的舰队的侦察舰队，派遣了一名少尉负责，这名少尉当然是有功劳的。
于是他手下就有了两支三级辅助舰队，一支二级辅助舰队，经过了一个半月四十多天的运作，他终于把自己的舰队全部建立起来了。
四十多天内，他一直考察整个水道，港口，舰队，编制舰队人员，接见各种军官和士兵，同时想着怎么稳固防守波多黎各，同时派遣刚刚两艘的侦察舰队去侦察周围，对周围的情况有所了解，同时不断接受情报，来自巴拿马的电报，对于本土或者其他舰队的情报，他是接不到的，他属于中下层军官。
他只能来自上级的一级辅助舰队的指导，来自主力舰队新建立的辅助舰队，三支一级辅助舰队，一支在科隆港对岸，一支在科隆港，一支在委内瑞拉的马卡波湾，主力舰队驻扎在科隆港扣，另外运河通航以后，主力舰队有一部分在大巴拿马城，大巴拿马城也有一支舰队，不过是先前组建的二级辅助舰队，和他舰队性质一样。
属于驻扎在科隆港口的一级辅助舰队的下属的一支二级辅助舰队。
四名中尉，九名少尉，三名军士长，二十名军士，这是他暂时的军官搭配，自从舰队建成以后，一个星期以后，他就带着舰队出海进行磨合训练，轮流驻守两个岛屿上进行后勤补给，驻守训练。
张思远很有收破烂的想法，在又修好几艘商船以后，他派包子去打捞那些被打沉的战舰，一艘一艘的拖回去，然后大块大块的拆解，给那些岛上的俘虏找点事情做，三万多的俘虏，清理两座被炸坏的岛屿港口，修筑防御工事，修理道路，这些事情，用了大约一个月时间都完成了，除了那些重伤的俘虏有的死掉两千人以外，其他的俘虏基本上痊愈了。
这就给他们找点事情做，不能让他们闲着，于是出海打捞沉船，回来拆解，就是成了俘虏们的工作，加上原先港口里面的沉船，清理水道，俘虏们忙的不可开交，虽然锻炼了他们的身体，可也让他们没有时间思考，思考那些逃跑或者对抗的事情。
不过三万多俘虏对于两座弹丸大小的小岛还是太大了，在请示了上级的一级辅助舰队的上尉以后，他命令包子率领他自己的三级辅助舰队，加上两艘驱逐舰，以及这边的商船，运送了一万八千多俘虏去南美，交给罗左负责看守和使用那些俘虏。
包子走了以后，侦察舰队负责起圣胡安的驻守工作，然后主力舰队的一艘驱逐舰被派去驻守，舰长担任指挥官，压阵圣胡安。
至此，张思远自身的舰队实力已经基本上定型了，并且恢复了原先驻守这里的上尉带领的舰队的八成实力，张思远对于接下来的驻守十分有信心，但他并不是担心自己的驻守任务不能平安完成，他想着的是，如何才能建立更高的功业，因为现在新秦国同英国人的战斗形势依然不是和明朗。