水手火枪队副统领林水生带着主力部队向井里汶急进，救援被困在那里的华人。这时，中华公司水军舰队方面的人员，还不知道李丽华的行踪。三宝垄堡垒逃出来的荷兰人沿着海岸线向西逃跑，打算和巴达维亚的荷兰军队会合。井里汶地区就挡在他们的去路上。
叶华和林水生、情报主管安小四商量之后，南洋特遣舰队派出十艘快船去东南西北各个方向搜寻荷兰舰队的主力；中国舰队的目标依旧是找到荷兰舰队主力寻求决战。
三宝垄的荷兰军残余士兵中途和马达兰叛军汇合了，现任国王帕库布沃诺的三弟是叛军首领。他的部队组成中，有100多名荷兰炮兵，还包括了一队马都拉士兵，大约有3000余人-这是三王子向荷兰东印度公司和马都拉国割让土地所得到的报酬。
人数总计有20000以上的马达兰叛军、荷兰、马都拉三方联军，正在逼近井里汶的中华公司甘蔗庄园。
200名三宝垄荷兰守军撤退到井里汶时，只剩下150多人了，正好遇到三方联军对井里汶发起攻击。
尾追的中华军水手火枪队并未去救援井里汶，而是向井里汶以西的中华甘蔗庄园进发。在他们来到井里汶地区的前一天早晨，中荷海军主力部队在井里汶外海不期而遇。
于是，这个时代，这个地区，东西方两支最强大的海军爆发了爪哇海海战。
在海滩边，本来打算搭乘海星号离开爪哇岛的李丽华一行人，目睹了这一场海战。海星号无法偷闯荷兰人战舰阵列，只好在外海游弋。
叶华的舰队本来从三宝垄出发，西行搜索荷兰舰队。在井里汶外海遇到荷兰舰队主力，他们也感觉很突然，但更多的是喜出望外：中国人此刻最希望的就是来场决战，早点打完早点返回马尼拉，西班牙人即将来了.
海军上将乔里斯.斯皮尔伯根的舰队，包括欧洲来的船只、原先的巴达维亚舰队在内，本来有五艘主力战列舰，另外还有十一艘快船，八艘辅助船，水手和士兵3000人左右，还有当地爪哇土著辅助兵数百名。
中华公司南洋特遣舰队袭击巴达维亚时，把鹿特丹号战列舰打成了垃圾，另外有一艘荷兰战列舰去了马六甲，因此，两军在主力战舰的数量上已经失去平衡，中华军飞字号五艘主力战舰几乎毫发无损地出现在海面上,而荷兰舰队只有三艘战列舰，在其他战船数量上都处于劣势，不过荷兰人的中型战舰-快船一类的战舰装备大炮的数量，却是超过了中国舰队同一类型的炮舰的。原先打算攻打井里汶的荷兰海军上将乔里斯.斯皮尔伯对中国舰队实力并不了解，对于西班牙、葡萄牙人远东游记中关于中国海军船只的说法，他是非常相信的。
因此海军上将乔里斯.斯皮尔伯根也希望来一次决战，彻底解决中华公司问题。
两军很快排列成阵列，荷兰舰队由西向东运动、中国舰队由东向西机动，都是用船体一面侧舷对着对方，准备用船舷排列整齐的炮窗中的大炮轰击对方。这是标准的风帆战舰时代的阵列线对轰战术。此时的风向是吹向北方，对靠近海岸线布阵的荷兰舰队稍微有利一点。
中华公司舰队在组建初期，荷兰军教官室出了很大力的，因此两支舰队的水手、炮手们都是同样训练有素、纪律严明，而且基本战术动作都是一样的。
两只舰队相隔一里左右用阵列线对轰，中华军拥有的霹雳火箭在射程上有优势，但是准头奇差，因此两军主要还是靠船侧的大炮对轰。
两只舰队上千门大炮轰鸣，硝烟弥漫，海水沸腾，无数发炮弹在两军阵前你来我往。无数的中国与荷兰的水手、炮手以专业精神、战士的勇气和智慧，在弹片飞舞的上甲板上奔忙、在炮舱内呛人的硝烟中开炮。
两支舰队有一阵子打得势均力敌，观战的李丽华等人几乎以为两军就此会永远这样轰来轰去，没完没了。
从早上到中午，中华公司舰队有一艘福船炮舰被击沉，数艘小型辅助船被击毁。战争在铸造生死与共的热情和献身精神的同时，也在铸造冷漠、残酷和野性，二者是统一的，统一于战胜敌人的目的。叶华率领的南洋特遣舰队全体打出了真火，乘着中午时风向转为北风，全体开始了冲锋，原先排列整齐的阵列线顿时乱了。
但是，中华舰队虽然放弃了阵列线战术，但是并未陷入混乱，而是以一艘主力舰带上五艘中国帆船，用主桅杆顶部的旗语、船尾的金鼓作为通讯联络工具，分成五队冒着敌方密集的炮火冲锋。
很快，中国舰队逼近了荷兰舰队的阵列线，在两百步距离开始释放霹雳火箭。
荷兰人为了躲避那些漫天飞舞的火箭，只好也打散了阵列线。就这样，开战两个小时后，双方都没有重要战舰被重创，但是却几乎同时打乱整列线，开始了混战。
这一下，尹峰“发明”的小队海战战术、艉射战术终于可以发挥作用了。
荷兰人非常不适应中国人的这种近战战术：这一方面是训练水平的体现，同时也是两国海军对于海战战术理解不同的结果。尹峰教导他的舰队重视对于战舰船体的攻击，目的在于摧毁敌舰的航行能力，并最终使其船体破损沉没。而荷兰海军则重视对于敌舰帆桅的攻击，目的在于杀伤对方舱面人员和降低其机动能力，然后最终击沉或者跳帮夺取对方战舰。
中国人的阵列线散开后，大量小型船只发挥了作用，从荷兰舰队的两翼开始了迂回包抄行动，战斗的天平在向中国人方向倾斜。
每艘中华公司舰队都在船头装备号称“粉碎机”的重型大炮，是专门设计来破坏船板的，威力巨大。最大的飞虎号有三层甲板，密布着炮窗；还有甲板上的几十具佛郎机，用来抗击敌人的近距离跳帮进攻。
而荷兰人的战列舰，按照大小分为一层，两层，三层，甚至四层战舰，每层两舷是走廊样的火炮甲板，安放排成长列的大炮，中间则是交通通道。战舰两侧是十至几十英寸的木质船板，双方接舷作战时很难打穿，即便打穿，实心的炮弹也只能洞穿一个窟窿，杀伤力有限。
战舰装甲最脆弱的部分则是舰首舰尾，因为排成战列的时候，舰首舰尾面对的都是友舰，无需特别的保护。遗憾的是天算不如人算，荷兰战舰的设计师没想到尹峰会搞出这种艉射战术：主动打乱自己一方的阵列线，突破进对方的阵型内进行攻击。
中国战舰绕到敌舰尾后，用船头穿甲弹猛轰对方脆弱的艉楼，然后对准炸开的窟窿，向敌舰内发射喷射式的霰弹。由于当时欧洲风帆战舰内部从头到尾没有隔板，这样发射的霰弹可以从舰尾一直打到舰首，在整层甲板上造成屠杀般的杀伤效果。
这样一来，荷兰军的人员损失直线上升，炮手死伤异常惨重。曾经逃脱了中华公司舰队追击的赫克托耳号战列舰被两艘飞字号首尾围攻，互射两个回合之后，赫克托耳号舱内人员伤亡达到了600人的惊人的数字，八成的炮手非死即伤，已经基本失去战斗能力了。
激战中，叶华的旗舰飞虎号一直在寻找荷兰舰队的旗舰。
三艘荷兰战列舰已经有一艘被打残了，其余中型战舰已经有三艘被击沉。但是荷兰舰队还在顽强抵抗，而且还能互相支援，这说明他们的指挥系统还完备无缺。
现在，唯一的问题就是找不到荷兰人的旗舰。这让荷兰军在损失惨重的情况下，依然不崩溃，有组织的抵抗持续了相当长的时间，荷兰的舰长、将军们也可称是克尽职守，荷兰舰队后卫编队的指挥官阿尔发将军在战斗中身负重伤。
最后，还是叶华的旗舰飞虎号主桅望斗的瞭望员用望远镜发现了海军上将乔里斯.斯皮尔伯根的将军旗在阿格硫斯号上。
叶华立刻命令发出火箭信号，集中了三艘主力战舰围攻阿格硫斯号。同时，中国人众多的小型船只象蚂蚁一样蜂拥而上，用大炮围攻周围的荷兰战船，把他们和阿格硫斯号隔绝开来。
井里汶外海海战进入尾声，荷兰海军上将乔里斯.斯皮尔伯根的旗舰阿格硫斯号以一敌三，恶战一个时辰，全船有超过五百人伤亡，成堆躺在船舱内的大多数炮手尸体没有头，殷红的鲜血流淌成河，从船舷的各个破口中流入大海。在可怕的“艉射”战术造成的后果面前，斯皮尔伯根上将已经完全丧失了战斗精神。
傍晚的夕阳下，最后一艘坚持抵抗的荷兰战舰降下了荷兰的奥伦治家族旗帜，挂上了白旗。荷兰人的三艘战列舰被击沉两艘，海军上将乔里斯.斯皮尔伯根的旗舰阿格硫斯号投降被俘。除了三艘快船向巴达维亚逃跑了，其余荷兰战舰非沉既降。
叶华的飞字号战舰只有飞豹号受创严重，另外福船型炮舰、小型快船被击沉八艘，总计死伤六百余人。
中国舰队基本上算是完胜了此次海战，完成了在年底前消灭荷兰舰队的任务。