从心底里而言，沈有容并不赞成此时对中华公司开战。一则他对尹峰其人有好感，并不认为他一心要造反，只是出生海外不晓得朝廷威仪，需要**和安抚；二则，他虽然认为中华公司不应该对吕宋夷人妄动刀兵，但是尹峰出兵吕宋，却是受到沿海各家出海商人所支持的行动，官兵此时去给尹峰背后插上一刀，会使福建的老百姓与官府离心离德。
无奈巡抚、总兵等上司严令他出战，作为有着标准军人作风的沈有容没有办法，只好听从命令领兵出战。
这几年间，他早就通过渔民、暗探打听过澎湖的守备情况；事实上每年的官兵汛兵驻防澎湖时，和中华公司的人一向相安无事，甚至这两年铜山水寨汛兵都是走过场，去澎湖待几天就回家了。但也因为这样，中华公司在澎湖岛上的防御情况，官兵这一方也是比较了解的。
中华公司在泉州方面的暗探也打听到了官兵的动向，澎湖和台湾都已经有所准备，但是并没有打听到官兵出兵的确切日子。沈有容抢在主将罗一闻之前，擅自出兵，再次发挥了他的指挥能力，硬是让本部水师连夜赶路，由熟悉澎湖水道的郭家兄弟带路，在深夜里袭击了澎湖岛。
沈有容就是这样的军人，虽然不赞成此次行动，但是一旦动起手来，就力争要做到最好。
虽然中华联合公司驻防队在西屿的南部海角设置了观察哨，但是在漆黑的夜晚，沈有容冒险只让领路船点上一盏灯笼，其余战船都跟着这盏灯走。结果，西屿的中华公司哨兵因为疏忽没有及时报警，让沈有容的40条战船冲进了马公港内海。
港内测天岛上有一木制临时灯塔，是中华公司所建，也有哨兵把守。总算测天岛的哨兵及时作出了报警，用三磅炮及时发炮告警，顿时整个海湾滚雷般响彻了炮声。
原先中华军的驻守地在娘妈宫，就是几年前和荷兰人激战的地方。现在，中华公司护卫队驻守的商馆要塞在马公港南线的风柜尾。这里面对陆地的一面地势较高，面对着一片丘陵和砂石地；另一面靠近海湾，海岸线完全处在商馆要塞的大炮射程之内，海滩狭长，不利于敌人登陆攻击，第十二战船队的船就停泊在那里。
战船队统领是崖州疍民的麦家子弟，年仅二十岁的麦芽子。他们虽然也接到了泉州方面的告警，但无论如何没想到官兵水师敢于夜间偷袭，大多数水手还在堡寨内睡觉。在当时的技术条件下，海上偷袭的难度可想而知，他们这么想也情有可原。虽然水手们听到炮声赶紧起床，但是只有两艘双桅船上有值班水手值夜，及时地升帆起锚，其余的战船都遭到了浯屿水寨官兵的火船攻击，转瞬间被烧得一塌糊涂。所幸水手们伤亡不大，大多数人还没来得及上船，自己的战船就已经着火了。
麦芽子自己倒是在一艘战船上值夜，带着另一艘船及时冲出停泊地，用火炮、火药桶、火箭开路，依仗自己熟悉水道，沿着海岸线冲出了官兵包围，前往台湾告急去了。不过，另一艘战船的弟兄为了掩护麦芽子，主动掉头冲向官兵战船，结果被几十艘水师战船围殴，沉没在了澎湖湾。
丢掉了战船的200多名水手及时撤退到了商馆堡寨内，协助驻防队步兵弟兄用大炮和火箭击退了沈有容的水师。
沈有容的密探从来没能进入到堡寨内侦查，所以沈有容没有料到小小的堡寨内竟然有大炮和火箭，而且数量不少。
这一要塞堡寨是个四方形带石头围墙的建筑，长宽都是70步左右，四角有望楼，石墙高约一人，每一面都有两个突出的炮座和敌台，使得墙角根本没有射击死角。堡寨四周挖有一圈一人宽一人深的壕沟，四边有门，用活动的吊桥来进出。
石墙不高，但是里面沿着墙搭有木制平台走廊，刚好可以让守卫者探出脑袋用火枪向墙外射击。这种借鉴了所谓意大利式多棱堡体系而建立的小型防御工事，可以充分发挥火器的作用。而且，堡寨拥有三门二十四磅铸铁炮，全在面对大海这一面，是一个月前刚刚运来的中华公司自己生产的最新式火炮；另外还有十二门轻型野战炮。驻防队全部换上了带刺刀卡座的燧发火枪，水手们有一半拥有火绳枪。其余水手也大半拥有弩箭和刀剑等战船上的肉搏武器。
按照明朝官兵的配置，堡寨内的560人中百分之八十拥有的火器，这还不包括大炮火箭，那配置实在是太豪华奢侈了。
沈有容的40艘战船上，除了每艘船上有一门佛郎机铳外，自己手下的近千兵丁，只有五十名鸟铳手，五十名快枪手，其余全是冷兵器。而且，这鸟铳是早期日本火绳枪的改良品，就是戚继光从倭寇那里得到的样式，80年前的东西了；快枪这是质量更差的火绳枪，没有准星也没有托手，射程很近。
因此，沈有容在解决掉中华公司水军战船后，刚刚鼓动士兵发起登陆战，就被劈头盖脸的火炮火枪火箭打得措手不及，有多艘战船被大炮直接击沉，官兵们被密集的霰弹、火枪铅弹打得在海滩上死伤一片，其余的人完全没有火器战的经验，手足无措地在沙滩沙滩上乱跑。
沈有容一时间也有点发懵了，正要下令收兵，忽见堡寨面对大海的北面望楼发出一支火箭，拖着长长地尾烟，带着尖厉的哨音，径直扑向沈有容挂着号旗的旗舰。
“轰！”火箭在射程极限处落向大海，在离沈有容座船十几步开外的海面上炸开，腾起一团火焰，这团火竟然在海面上还能燃烧。这是中华公司兵器研究部刚刚发明的直杆火箭，战斗部带着大量的桐油和火药，专门用来烧船的。
沈有容虽然身经百战，却从来没有在海上作战时遇到如此猛烈的火器攻击，不由地毛骨悚然出了一身冷汗。
不知为什么，对方突然停止了射击。沈有容也不多考虑是否有诈，赶紧把自己的兵丁全数撤回船上，然后把船驶离这片海滩，远远地停靠在马公港海口，距离中华公司商馆堡寨足足有五里地。
罗一闻的3500兵丁，100多艘帆船的大队在第二天中午才赶到，发现沈有容抢了头功，罗一闻十分地恼火，仗着自己有总兵朱文达撑腰，抓住沈有容抢滩登陆时死伤过百的事把他斥责一番。然后，他让沈有容所部官兵水师去澎湖湾口巡防，远离战场一边凉快去，进攻堡寨的主攻部队成了铜山水寨和漳州卫、泉州卫的官兵。
罗一闻所部官兵首先占据测天岛和娘妈宫构筑营垒，一连三天没有进攻商馆堡寨。
中华公司澎湖商馆堡寨的守备队长是原先步兵第二哨的什长赵宣明，是赵家澳赵铁的一个本家侄儿。他曾经在西班牙使者来台湾时守卫过港口码头，和西班牙人交涉时严守纪律，因此到军校培训几个月后，被调到了澎湖驻防队担任队长。
赵宣明很不情愿调到这里来，他想着是去吕宋打西班牙人，为自己兄弟报仇。如今官兵无端前来进攻，他就把满肚子火气撒在了官兵身上。他在战船队失利后，把遍布全岛的中华公司岗哨全部撤回堡寨内，放弃了西屿、测天岛和娘妈宫几处据点，把所有人员和物资全部集中到了风柜尾堡寨内。
官兵们不来进攻，赵宣明就主动出击，晚间偷袭罗一闻的娘妈宫营地，用新式铁皮手雷把整个营地炸得翻天覆地、官兵们晕头转向。追击出去的官兵不熟悉岛上的路，结果在漆黑的夜晚又被偷袭，被一群熟悉跳帮肉搏的水手杀得尸横遍野，出营地追击的漳州卫一个百户官战死，二十多名官兵被杀，包括在营地内被手雷炸死、混乱中自相践踏而死的，罗一闻所部在一夜之间就战死了100多人，伤者无数。
罗一闻完全是轻敌了，他才不信沈有容说的：堡寨内守军拥有大量火器。他认为这是沈有容为自己战败找借口。
营寨被偷袭后，他恼火了，驱赶着3000官兵沿着海岸线由陆路进攻风柜尾堡寨。
风柜尾堡寨面对陆地这一面具有地形优势，加上堡寨内强大火力，官兵的进攻结果可想而知。罗一闻的兵丁甚至没有一人能接近到堡寨50步范围内。赵宣明知道沈有容是谁，尹峰曾经告诫他们不要和沈有容所部冲突，所以他才会在第一天的战事中放了沈有容一马；铜山水寨的兵丁他就顾不着了，把十门野战炮集中在官兵进攻的前锋线这一边，用密集的霰弹射击打得官兵成片成片地倒下。驻防队100名战士在墙头射击，墙下两排200名战士蒙头只管装弹药，然后把装好弹药的燧发火枪交给墙头的战友射击，几乎不间断的子弹扫倒了成片举着木盾牌的官兵。
绝大部分参战官兵没有对付纯火器战争的经验，虽然他们也有炮和佛郎机铳、鸟铳，但是射程根本还没有够着堡寨的墙头，中华公司驻防队的枪炮已经打到他们脑袋上了。战事一开始就演变中华公司驻防队对官兵的单方面屠杀。
一个上午时间，罗一闻的兵丁死伤了近600人。这一下把罗一闻彻底打蒙了，他完全束手无措了，只好退回自己营垒，死守不出，在风柜尾堡寨前丢弃了大炮一门，佛郎机铳数架，刀枪无数。
暂时休战了五天，罗一闻企图夜间偷袭，结果他的兵丁在堡寨壕沟外踩上了带着钢轮发火装置的地雷，无端被炸死了十多人，惊动了守军，在一通枪弹打击下不得不退了回来。此后的日子，罗一闻就是拼命向驻扎在泉州的总兵朱文达求援兵。
朱文达无可奈何，只好再次把集结在泉州港的烽火门、南日山水寨水师1000余人和大金千户所的旗军三百名派了过去，结果还是一样：根本无法接近中华公司的堡寨。
于是，朱文达一边调动福州中卫、福州左卫、福宁卫的官兵在泉州集结，同时向浙江总兵催促援兵。
浙江总兵所辖的温处参将、台金严参将所部卫所兵、游兵这一天刚刚到达泉州港。朱文达在这天发布禁鱼令，结果弄得福建沿海民怨沸腾。
朱文达对浙江调来的800名义乌兵很有信心，他们可是戚继光时代闯出名气的强兵，基本保留了一些戚继光教授的纪律和战法。这个时期义乌兵是很吃香的，大明朝全国各地一有战事，就抢着要调义乌兵去作战，结果使得浙江总兵、地方官等人不断向朝廷抱怨义乌因此人口减少，无力承担更多兵役了。这些天他一直忙于协调各地调来的兵丁，对浙江兵特别优待，待遇上给予十足的伙食，这在他来说是稀罕事；平常克扣属下兵丁粮饷对他来说是日常习惯一般自然。
朱文达在泉州府衙驻扎了亲兵100名，并且派出几十人在曾家和尹峰家的宅院附近监视。泉州府衙也派出衙役胥吏帮忙监视，但是朱总兵不信任这些本地衙役；这些人都和曾家以及中华公司有着利益关系，指望他们不帮倒忙就不错了。所以浙江兵到来的这天，他又派了名福州左卫的百户官，带着二十多名兵丁在华兴联号外围监视。
码头上挨了打的渔民是泉州的疍民水户，也没什么大名，人人称他为李七，也是中华公司在泉州港的密探暗桩之一。他第二天就以兜售卖鱼为名在泉州港外浙江兵临时军营外观察情况。晚间，他偷偷潜入泉州城北门一带，却发现华兴联号周边地方全是官兵在把守。
转悠了半天，已经夜深人静的时刻，他终于等到了机会；守在华兴联号后门的官兵全都缩在墙角睡着了。
李七借着墙角黑暗处的掩护，翻墙进入了华兴联号后院，熟门熟路直接去许心素的卧室，然后轻轻地在窗户上敲了一下。
中华联合公司暨华兴联号、华兴钱庄福建分号的大掌柜许心素压根没睡着，听到动静拿着燧发手枪从床上一跃而起，蹲在窗口小声问：“是谁？”
李七小声回答：“我，七仔啊”
许心素听出了来人声音，赶紧开门让他进来，也没时间寒暄了，直截了当问：“官兵情况怎么样了？”
李七抓起许心素桌上的茶壶，就这壶嘴咕咚喝了一口道：“又增兵了，这一次是浙江兵，听说有很能打的义乌兵。”
“多少人？”许心素点亮蜡烛，掏出纸笔，研磨写字，一边问道：“除了义乌兵还有那路人马？”
“浙江兵关防很严，不让我靠近营地，不清楚具体的人数；我看了一天，估计有三千人以上的浙江兵来了，他们带来上百艘船，船上还有一些水手、舵工，不晓得有多少人。”
许心素皱着眉头，摇摇头道：“前几天福建官兵又到了四千左右，这次浙江兵又有三千，这朱总兵好阔气，此次战事，官兵的兵力总计已经超过一万两千人了。不知道澎湖情况如何？”
李七哈哈一笑：“这个大掌柜请放心，我打听到澎湖堡寨依旧在船主的人手中，官兵死伤惨重，就是打不下来。”
由于澎湖战事，泉州沿海海路断绝，许心素现在还不知道马尼拉大胜的消息，他担心地摇摇头说：“兵力实在太悬殊啊！希望船主的大队快点赶回来！我这里只剩下最后两只信鸽了，这条消息发出后，我也无能为力了……希望澎湖还能再守一段时间！”