开始，双方还各自指责对方是用了什么卑鄙的手段，但后来越发紧迫的局面，令彼此间的指责也都顾不上了。在这种情况下，战争再也不可能进行不下去了。北方政府军迅速抛出了橄榄枝，表示要终止战争状态，愿意与南方部落联军共建蒙塔亚的和平局面。接下来，双方以令外界惊讶的速度草签了一个协议，表示继续承认《纳特尼（河）妥协方案》，然后北方军就狼狈地撤回了纳特尼河以北。
但谁又能知道，这仅仅是一个开始。
疫病，并没有随着战争的结束而结束。相反，因为战争的结束，北方军的北归。大量聚集在一起的人口开始移动和疏散，疫病出现了更为严重的扩散和流行。
大量的人员开始死去，甚至一些部族、村落整个地消失在伊玛拉草原上。原先一些兴盛的部族，到最后死得只剩下几个人。到后来人们甚至不敢单人出行或走远，因为人走在路上就有可能倒下死掉——不能及时发现和焚烧的尸体，可能会成为新感染源……
几个月的时间，当旱季再次到来的时候，伊玛拉草原上的人口已经呈现出了令人恐怖的缩减。据后来联合国的有关调查：战前，蒙塔亚南方各部落人口总数约为三百四十五万；近一年的战争状态，随着北方部族与南方部族间的仇杀，南方部落区人口骤减近七十多万；接着，可怕的疫病流行更是夺去了近百万人的生命，整个南方部落区人口骤减至总数不到七十万，可谓惨绝人寰。
与此同时，蒙塔亚北方也无法避免疫病的侵袭。由于北方军狼狈北逃，而且在北撤的道路上没有进行应有的处理措施，导致疫病在蒙塔亚北方也迅速地流行起来。更令人愤恨的是，愚蠢的北方军政府，因为担心自己在南方部落区所犯下的战争罪行被国际社会知晓，竟然一度禁止外国记者入境采访，采取了严格的新闻管制措施，结果造成了疫病传播信息的不透明。
直到最后，由于疫情越来越严重，并呈现出向境外扩散的趋势，这才引起了邻国和国际社会的注意。在国际社会的支援和一些人道组织的帮助下，大量的药品和医疗器械被运抵蒙塔亚，一些有经验的防疫组织和医疗队也深入到蒙塔亚南部部落区。在各方面近一年的努力后，猖狂肆虐的的疫情才逐渐被控制住。
如此一来，作为战争的始作俑者——蒙塔亚军政府的丑行也被曝光。最终，战争的发动者曼帕塔将军，被他手下的实权派将军马苏阿里取代。曼帕塔则在国人的谩骂和国际社会的指责下，身染重疾，郁郁而终。
疫病得到完全控制后，联合国有关组织进行了战争和疫病对蒙塔亚人口影响的调查，联合国的统计数字表明：此次蒙塔亚北方军政府对南方部落区所进行的战争，直接造成二百一十万人死于战火；因疫病造成二百六十万人死亡。两年时间合计，蒙塔亚人口锐减四百八十万，全国总人口从战前的八百七十万，骤减至后来的不到四百万——这一事件被当时的国际社会称为“二十世纪人道主义大灾难。”
后来查明，当时流行于蒙塔亚的疫病，是多种高致死率的鼠疫同时交替传播所造成的疫情。由于疫情的复杂性和交替性，疫情的控制与治疗显得更为复杂和困难，其破坏力比历史上令欧洲人变色的“黑死病”的疫情还要严重。而那时的伊琳正好年纪不大，她正是在那时从在达蒙部族进行医疗防疫工作的国际医疗组织那里，学会了一些英语对话。也是那个时候，达蒙人有了烧开水喝的习惯，也知道了一定要吃煮熟的食物。
疫情基本得到控制后，有一些原索约的居民回到索约，想重建自己的家园。结果他们却在索约周边的地下，发现了大量被集体屠杀的尸体。那些尸体身上只盖了薄薄的一层土，雨季的大雨把他们的尸体又冲了出来，浸泡尸体的臭水也随着雨水流到了河里。而雨季战争中的双方，当时正是饮用的这种水——国际卫生组织经分析认为：这应该是疫病突起的直接原因。
也许是由于有一些啮齿啃食尸体的缘故，索约在战争结束后的一段时间内，都被发现有病毒存在。一些去过索约的人被发现染病和携带病毒，在小范围内又发生过一定规模的流行，好在当时的国际医疗组织还未离开，因此疫情得到了迅速有效的控制。
也许是认为部族的迷信可以降低疫病的传播机率，国际医疗组织并没有出现澄清一些关于索约的传闻。这样，索约在各部族的心目中，就成了这样一个恐怖的所在。
近三个小时的路程，周吉平一行很快就到达了。