当然，在这场争论中，孙科也想与以江浙为代表的前光复会势力进行合谋，但是由于积怨太深，再加上杨兴的刻意打压，孙科未能实现借建都问题分化光复会残部与国民政府的关系。
为了建设首都，大会决定以武昌、汉口、汉阳为中心，面积达1万平方公里的中央政府直辖都市，即为武汉。
大会决定，湖北省政府则迁址荆州，重建湖北省政府。
本来以为其后会风平浪静，但是在这之后，孙科又在大会中捣乱。
孙科提出，按照《临时约法》，实行内阁总理制，但是该项要求，立即遭到一些议员反驳，大家认为，原来孙文也一直反对内阁总理制，如今国家还未统一，需要加强集权，不能够限制革命领袖的权力。
因为很多话，都是孙文曾经说的，所以孙科虽然非常不满，但是也无可奈何，在得到杨兴同意，在全国统一后四年内探讨国家政体，但是现在毫无疑问采取总统制。
而在这个时候，汪精卫提出，如今民主制度最为完善的共和国有两个，一个就是美国，另外一个就是法国，但毫无疑问，都是采用总统制。
美国是采用总统制，总统作为国家元首与政府首脑代表，负责国家最高行政权。
而另外一个运行良好的民主共和国法国，也是采用总统的，虽然有设定总理。
如此要探讨的不是内阁总理制，或者虚位元首制，而是我们到底应该学习法国的政体，还是美国的整体。
如果枉顾世界上成熟的经验，悍然施行内阁总理制，让总统作为国家元首，虚位化，是必然会失败的，就像在前几年那样。
就是寻找再亲密无间的战友，就像段祺瑞与冯国璋，二人几十年的兄弟，最后也势不两立。
所以，如果施行美国总统制，可以明确扩大副总统的职权，除了主持参议院工作外，可以让其多负责几个部门工作。
如此，这次大会在一波三折之后，终于回到正轨
但是，对这个大家意见很大，有赞成总理制的，党人也有赞成总统制的。
如此杨兴将那帮大佬，如张澜、唐绍仪、蒲殿俊、陈炯明、林森、居正、章太炎、于右任、胡汉民、汪精卫等人找来，一个一个商谈。
最后大家取得共识，政体需要在以后由制宪会议确定，在全国统一后，五年内完成正式宪法的制定工作，在这之前，实行内阁制，到后来，国民政府不持有特定立场。（目前中国，虽然是内阁制，但是国家主席通过是党的总书记，军委主席掌握实权。若不是这两项官职，仅仅是国家主席，就像宋庆龄曾经担任了国家名誉主席，毫无意义。就像在九大的时候，老毛悍然决定，不设国家主席，大概也是感到国家主席这个职位，名字虽然好听，设定出来，问题蛮大啊。
你让他掌权，如此将党的主席，军委主席，总理置于何地？你不让他掌权，如此谁敢？要知道自己毕竟是名义上国家元首啊。
所以台湾**那个老妖婆才会抱怨，副总统是深宫怨妇，大家想想，副总统既然如此，如果有虚名化国家总统，不让他掌权，应该非常难啊。
除了找胡适那种学者，其他的，有谁愿意当这个玩偶。
所以每每读史书，才感到孙文、宋教仁对中国危害之大，他设定了一个难以成功的政体，如此造成中国几十年的混乱。
更为可恶的是孙文，自己在南京不接受内阁总理制，竟然异想天开的让老袁接受这样一个政体，如此之下，民国内乱，责任有30%应该算在孙大炮头上，这个美国佬，害人不浅）
如果在临时约法中总统掌握国家实权，如此之下，也许老袁不会做出如此多的反抗，如此之下，南北不会对立，在果名档在南方执政的情况下，老袁也不大可能称帝。
如此之下，中国应该不会出现几十年内乱。
在这种情况下，什么抗日战争，苏俄对我们侵略，全部都不太可能。
所以，本书的写作背景，是考虑这样一个现实写出来的）
对于孙科提出，按照袁世凯的袁林样式，在南京修建陵墓，整个会场顿时炸了锅。
有人提出，修建豪华陵墓，乃封建帝王思想，如此绝对不可取。
有人认为，毕竟袁世凯死后，北洋花了70万大洋给袁世凯修了袁林，如此国民政府不能太拮据，舍不得花钱修建陵墓。
如此之下，该问题就显得非常尖锐化了，整个会场吵闹声此起彼伏。
当天下午，杨兴专门接见了孙科。
一见杨兴，孙科火气冲天，认为这些都是杨兴给制造矛盾，在孙文生前，杨兴做了活曹操，在死后，竟然不能让其安息。
看见孙科在哪里咆哮，杨兴耐着性子说道：孙哲生，你看这样可以不？我们民国承认的国家元首除了孙先生外，还有袁世凯、黎元洪、还有冯国璋也是我们共和国承认的国家元首。现在孙先生、冯国璋已经过世了，黎元洪不是在天津吗？我们可以请他过来，到时候在与国会议员，意见领袖一起商议，确定如何处理啊？
孙科一听，大吃一惊，要知道，他敢如此明目张胆的挑衅，主要是认为孙文是共和国已故的唯一国家元首啊，想不到杨兴一下提出了三个，如此之下，孙文的地位马上就下来。由唯一的变为之一了。
孙科嘿嘿笑道：杨征东，那为何不将徐世昌，将曹锟叫过来，好像徐世昌也当过国家总统啊，曹锟也好像是贿选总统啊。
杨兴点燃一根烟，猛吸一口道：孙哲生，不是选举徐世昌的国会是非法的嘛，不是曹锟是贿选的嘛。所以在目前，他们二人是不适宜承认的。
我们来说说袁世凯吧，虽然他当过皇帝，我也是最先反对他的。但是毫无疑问，从民国元年到民国4年，从南到北，还是承认他为民国总统吧，虽然要加上是一个给国家带上罪恶深渊的总统。
还有黎元洪，武昌革命坚守孤城，虽然有点被动，还是保存了革命果实啊。当时在南京临时议会上，被推选为副总统，在后来北京成立的议会中，还是被推为副总统，以及在袁世凯死掉后，被推为总统啊。
冯国璋，在袁世凯身前，是被合法的议会推举为副总统，在张勋复辟后，继任总统。
这些都是合理合法啊，虽然对袁世凯、冯国璋我个人有所鄙视，但是不能因为个人感情，而影响国家大计啊。
孙哲生，你说说呢？
孙科一听，苦笑不得，站在对面发怔。
杨兴内心一喜，想到自己在前世属于民盟会员，虽然与民革有点差距，看着孙科与宋美龄，突然说道：孙先生，你看这样可以不。
对孙先生去世，国民政府先拨出一定款项，给他作为治丧，你们是用他修建陵墓也好，像与美国那样，修建孙逸仙博士图书馆也好，这是你们的自由，这个你看可以不？
孙科摇摇头道：杨征东，拨款数目呢？要知道袁世凯去世，北洋政府是拨款70万大洋哦。
杨兴眉头紧皱，良久说道：孙哲生，这个要经过商议后才确定。要知道，刚才已经去电黎元洪先生，延请其回到武汉，商议国家元首退休礼遇制度。
孙科站起来，看着杨兴道：杨征东，我知道你对家父，怨言颇多。但是你可要知道，是家父创立了中国同盟会，如果在最后这点问题上，亏待了家父，我与你没有完。
听到这里，杨兴面色铁青，良久说道：孙哲生，这样吧。等下会议中，成立一个专门的委员会，由胡展堂领导，包括国会议员，社会学者，你们孙家1名代表，黎元洪家1名代表，冯国璋家1名代表，共同商议国家元首退休礼遇制度，你看如何？
杨兴一看，你孙哲生来回捣乱，既然你自恃乃前非常大总统的儿子，那么既然如此，我给你找几位国会选举的合法总统，如此之下，你再想凭借前总统的儿子胡作非为，那就对不起了。
因此，虽然非常鄙视冯国璋所作所为，认为其挟持满清而自重，但是为了政治，不得不如此。
孙科还想说什么，旁边林森劝阻道：哲生贤侄，如果由胡展堂任主委，我想还是比较公正的，那就这么办吧，我是没有意见的。
孙科一听，眼睛几乎要吃人，瞪着林森，良久没有再说什么。
杨兴内心大笑，良久说道：孙哲生，要知道我们国民政府还是讲情义的，对健在国家领导人，我们可以发放薪水的50%，以供其颐养天年。
对已故国家总统，对其遗孀，在其还健在的，我们可以发放20%的薪水，以避免孤苦无依。
听杨兴如此说，孙科嘿嘿笑道：哦，原来如此，既然如此，那么那个宋小姐，竟然可以获得这点生活补助，你们也可如此陷家父身后事而不顾啊。
杨兴哈哈笑道：孙哲生，这是制度，并不仅仅针对你们，而且还包括袁家、冯家、黎家。所以千万不要误会。
但是不论如何，孙科认定孙派人士出卖了孙文，如此之下，整个兴中会旧部陷入一片内斗之中。
而杨兴要的就是这个效果，看到孙科与孙氏旧部等人分裂后，看到自己面临问题得以解决后，不由得长舒一口气。
如此之下，终于扫除孙科的阻扰，大会得以继续召开。
随后会议决定，中国民主革命需要进过三个阶段，那就是军政、训政、宪政。军政委从北伐开始到全国统一之后5年。训政为全国统一后五年到全国统一后20年。宪政为全国统一后20年开始宪政。
大会选举杨兴为果名档总裁、张澜、林森、章太炎等3人为副总裁，谢持为***秘书长，选举熊克武、李根源、张静江、顾品珍、居正、于右任、钮永建、杨永泰等32人为***中常委，选举陈炯明、汪精卫、杨庶堪、孙科、黄一欧等153人为***中央委员。
根据果名***委员会提名，决定向国民议会推举张澜临时国会议长。选举林森为国民政府主席，杨兴为副主席，军事委员会主席。
根据林森提名，选举杨兴兼任行政院院长，国民革命军总司令，选举唐绍仪为副院长。
根据林森提名，向国会推举章太炎担任监察院院长
谭延闿担任考试院院长
于右任担任司法院院长
根据杨兴提名，并报国会批准，确定各部部长名单
国防部长：熊克武
外交部长：顾维钧、副部长：汪精卫
财政部长:黄大暹
司法部长：王宠惠
民政部长：杨永泰
内政部长:陈炯明
工业部长：杨庶堪
商贸部长：张静江
农业部长：但懋辛
水利部长：程潜
交通部长：胡汉民
铁道部长：颜德庆
教育部长：蔡元培、副部长：晏阳初
宣传部长：曾琪
中央银行行长：徐代戡
秘书长：伍非百
对军队，重新进行改编：
总司令：杨兴
副总司令：熊克武
参谋总长：顾品珍
参谋次长：蓝天蔚、李烈钧、杨杰、白崇禧
后勤部长：潘文华
宪兵司令：蔡济民
训练总监：蒋百里、副总监何应钦
宣传处：鲜英
军情处：赵渭宾
第1军军长：王瓒绪，驻防湖北，卫戍首都
第2军军长：李家钰，驻防云贵川
第3军军长：杨森，驻防两广地区福建。
第4军军长：刘湘，进驻襄樊。
第5军军长：黄毓成，驻防闽浙
第6军军长：李宗仁，驻防江苏徐州
第7军军长：金鼎汉：驻防湖南浙江
第8军军长：钟体道：驻防陕西
第9军军长：李济深：驻防淞沪
第10军军长：王铭章，驻防江苏
第11军军长：唐生智,驻防安徽
第12军军长：张发奎，驻防陕北
第13军军长：杨兴（兼任）驻防河南
第14军军长：杨虎城，驻驻防陕北
第26军军长：邓锡侯,驻防甘肃、青海。
建设兵团司令：罗佩金、副司令颜德庆
海军司令：温树德
空军司令：黄光锐
宪兵司令：蔡济民
炮兵司令：赖心辉
杨兴要求各部即可就地补充兵员，加强训练，克日准备北伐。