而在广东，
孙文与桂系矛盾，已经到了水火不相容的地步，在这种情况下，为了寻求革命势力的支持，孙文让正在拜访唐继尧的章太炎，顺便川省与杨兴等革命同志进行会谈下
支持孙文护法主张的势力，包括三方面：一是西南军阀；二是孙文系；三是海军。
在孙文率领非常国会到达广州后，与西南军阀矛盾就尖锐化。
陆荣廷公开对众人说道：孙大炮之政府，乃空头政府亦。对孙文向各地发放电报，则需要收取现金。需要一手交钱一手发报，没有钱，根本不允许发报。
而唐继尧也公开宣称，自己不承认孙文之护法军政府亦。
二人都坚决推辞，不愿意就任护法军政府元帅。
而孙文在建立护法军政府的做法，也让海军产生深深的疑惑，与孙文渐行渐远。
在决定护法军政府的时候，有人建议采用合议制，还有一些人建议公推陆荣廷为西南盟主，以此来主导护法事宜。
特别是海军，本来跟随孙文南下，是因为孙文从德国人那里搞了200万马克钱，但是到广东后，银钱无着。
而在这个时候，掌握两广财政的桂系为了孤立孙文，允诺每月拨付10万大洋作为海军军饷。
在这种情况下，海军遂因此而转向，“先是依违于桂系和孙文之间，以后更骎骎倾向桂系”
现在看到孙文过于理想化，竟然抛弃与西南军阀和好之机会，自己担任起护法军政府大元帅，如此必然将桂系搞到堆里面上，从而演变成内部矛盾。
在这种情况下，包括伍廷芳、唐绍仪、程璧光、李烈钧等人士也认识到孙文在蛮干，如此做法，怎么不会失败，而不肯就职。
在这种情况下，孙文被迫任命了一批中华革命党的骨干和原同盟会或***的激进分子代理各项工作，以此才避免护法军政府空转。
但是在这种情况下，桂系与孙派矛盾，势同水火，双方都想将对方赶出去，如此演变成更大的冲突。
***激进派玩弄民意，组织几个代表团到大元帅府状告桂系督军莫荣新，说什么莫荣新开设烟馆、赌局，征收苛捐助杂税，开得民不能聊生。广东人民非常怨恨，希望孙文可以严惩莫荣新。
要知道护法军政府到达广州后，那帮国会议员，那个不是自视清高，烟馆、赌局层出不穷。
而得到这个消息后，孙文以此为借口，1917年底决定以武力驱逐桂系督军，命令海军炮轰督军署所在地观音山。但是程璧光唯恐开罪桂系，拒绝执行，并把海军舰艇都调至黄埔，严加看管，以防孙文直接指挥海军。
不久，发生一桩大事，那就是海军打死了孙文侄子。
原来为了建立护法军政府，孙文子侄全部上阵，其侄子孙振兴从海外归来，积极帮助孙文招募军队。
孙文看到海军不听自己的，甚为恼火，让***激进派，侄子孙振兴大肆招兵买马，大概是认为，你们不服从我，是不是认为我力量弱，若是我兵力强大后，到时候看你还服不服气。
这日经过黄浦江，孙振兴运送新兵经过黄浦江的时候，被海军临检。
孙振兴仗着海军与自己叔父的良好关系，一副公子哥派头，如此之下，与海军发生对峙。
海军一些士兵气恼不过，开枪将孙振兴打死了。
听到这个消息，孙文当即咳血，声言孙振兴被杀，如此深仇大恨，必然要报（不知道后来程璧光被暗杀，是不是与这个有关。反正在程璧光被暗杀后，孙文说程璧光是烈士）
看到孙文与海军矛盾激化后，莫荣新感到万分高兴，立马准备报复了。
听闻孙文卫队中有人过去从匪，当即以孙文卫队通匪为名。1918年1月，莫荣新拘捕了大元帅府卫队十名新兵，枪毙连长、排长和卫兵多人。
正在会议室开会的孙文，听到这个消息后，悲愤得掉下眼泪：“莫荣新这贼人，杀害我多名同志。为了大局，我一直容忍着他，如今他却开始屠杀无辜良民，如果再不惩罚他，将会祸害无穷。”
鉴于上次没有指挥动海军，当夜十二点，孙文登上“同安号”军舰，向驻扎在观音山（今粤秀山）的莫荣新督署开炮。
舰长犹豫不决，双手发抖，不敢开炮。孙文气得怒目圆睁，一手拨开舰长，亲自打了几炮，然后督促炮手：“你们就照我这样开炮。”顿时，连珠似的炮弹，隆隆作响，惊天动地直朝督军署射去。放了一轮炮弹后，大地死亡一般的沉寂。
孙文感到纳闷，转身吩咐卫士黄惠龙、马湘：“你们去搜索一下。”参军祁耿寰连忙劝告陟中山：“万万不能，万万不能。想必莫荣新早已有了准备，若贸然地过去搜索，可能会白白牺牲。”孙文又用望远镜仔细观察，发现荒草之中果然有许多人影。事后孙文才知道，早有人把炮击督军署的计划密告给莫荣新了。
第二天，莫荣新穿着白夏布长衫，手执长烟杆，只身来见孙文。孙文开门见山地说：“我为什么要用大炮轰你？因为你执掌广东军政大权，却弄得民不聊生。国家的主人是人民，你地却将主人如此虐待，实在是违法乱幻到了极点！”莫荣新听后，一时之间无言以对。
孙文继续说：“你知道吗？现在广东同胞有代表来见我，要我将你从严处罚。”
莫荣新连忙很恭敬地回答道：“是我的错，我干得不好。”我来时没有坐汽车，沿途步行视察市面，觉得商业十分萧条，但有很多烟馆和赌馆，我回去后必定大力整顿，不负广东人民的托付……”
如此做法，方避免桂系与孙文全面对抗。
但那以后，为了反制孙文之元首政府，1918年1月，由桂系发起，要求改组军政府，规定以滇系唐继尧，桂系陆荣廷和海军程璧光为联合军事代表，而孙文则只居一个政务委员空名。
2月，又由***稳健派人士出面，正式提出改组军政府的主张，并拟定《中华民国军政府组织大纲修正案》七条，其中心用意在于改大元帅单独首领制为若干总裁合议制，从而将孙文等激进主张排挤。
可以说孙文与海军、与桂系，那些有国仇家恨，有同志的鲜血，而与杨兴，则主要是理念争执。
而此时，杨兴所任命的驻军护法政府总办杨庶堪赶到广州，在孙文的重要幕僚，大元帅府参议，代秘书长谢持陪同下，前往拜会孙文。
谢持(1876－1939)***官僚。四川富顺人。原名振心、字铭三，又字慧生。后曾改作愚守。死后也是国民政府明令国葬之人。
谢持早年参加同盟会，与熊克武、杨庶堪等人多次组织与领导川人反对清王朝统治，在蜀军政府于重庆成立后，任总务处长。
辛亥革命胜利后，谢持当选参议院议员。在宋教仁被刺身亡后，谢持与黄复生、宋教仁秘书周予觉等人密谋刺杀袁世凯，因谋事不周，致周予觉被捕叛变，供出所谓“血光团”暗杀活动成员，致谢持等多人先后被捕入狱。
袁世凯得悉抓获了刺杀他的“乱党骨干”，欲将谢持等人处以极刑，遭到参议院以“擅捕议员”为名的严正抗议，加之谢持等人入狱后拒不吐实，一时无法落实“血光团”的谋杀证据，迫于压力，袁世凯便耍了个花招，一边答应放人一边准备派人将这些人放出后再加以暗杀，然后又嫁祸于人。
此次刺杀行为为谢持在***内部赢得巨大声誉，在那之后，谢持出狱，远走日本，获得***内主持党务的陈其美欣赏，并获孙文的信任与倚重，在党内地位扶摇直上，与杨庶堪一道成为革命党在四川主盟人，现在担任党务部长，护法军政府代理秘书长（1921年任秘书长）
在川省内部，谢持、杨庶堪、颜德基、黄复生、卢师谛等人组成实业团，秉持孙文意志，与熊克武等人组成的九人团相对抗。
乃川省重要的革命领袖，在反对袁世凯失败后，一向作为孙文重要幕僚在其身边工作，最后成为西山派领袖，***右派重要头目。
他反清，后来也**；他拥护孙中山，后来成为“西山会议派”领头人；他曾反蒋介石，后又拥蒋；他制造了分裂，又四方奔走呼吁团结；晚年他又为抗日奔波，尽显拳拳爱国之心。
特别是在其死后，蒋介石明令国葬，可以说荣集一身。
现在，看到老友杨庶堪被排挤到羊城，满脸铁青，一面引着杨庶堪前往大元帅府，一面数落道：沧白，想不到，想不到这个杨兴竟然过河拆桥，我们革命党人帮助其在护国战争中，成为川督方面出了大力气。现在可好，刚刚成为川督，就宣布搞什么中国人民党，与孙先生抗衡，就将沧白兄排挤出来，还美名借助沧白兄的名气，改善与护法军政府的关系。
杨庶堪叹了一口气，看着颇为义愤的谢持，拍了拍肩膀道：慧生啊，这个杨兴难以理解。不过，这总算好的，杨兴不是说为了改善与护法军政府关系，任命愚兄为驻护法军政府总办，一年办公开支可是有1万个大洋，如此也可改善大元帅府拮据的经济状况啊。
谢持一听，大喜，拉住杨庶堪的手道：沧白兄，辛苦你了。