我是高中生侦探工藤新一，当我和青梅竹马的同学毛利兰去游乐园时，目击了黑衣人可疑的交易现场，当时我只顾着偷窥，不对，是偷看。却忽略了从背后而来的另一个同伙。我被那个男人强灌了药物，等我醒来时……
我的身体已经缩了！要是让他们知道工藤新一还活着，不但我的性命难保，还会危害到我周遭的亲人。在阿笠博士的建议下，我隐瞒了身份。当兰问及我的名字时，情急之下，我化名为江户川柯南。为了搜集那些家伙的情报，便住进了其父亲以侦探为业的兰家中。
虽然还没有查到黑衣人的真正面目，不过，赌上侦探之名，我一定要跟他们做个了结。身体虽变，但头脑一样灵活，任何难题都能解开的名侦探！
我坚信，真相永远只有一个！
可是，现在却有一个神秘的人出现在我面前，他叫目暮星辰，是我的同班同学，也是目暮警官的独生子。
我曾拜托阿笠博士偷偷调查过他，如果不是有着完整的背景资料，我绝对有理由怀疑他和我一样，是喝下药物变的成年人。
在美术馆杀人事件发生后，我找到他，希望他能给我个交代，结果却收到他下达的战书。
我一直认为所有的罪犯都应该受到法律的制裁，无论拥有多么充足的理由，我们都无权剥夺他人的生命。但是目暮星辰这个家伙却要帮助真凶掩饰罪行。
我承认，有些人是值得同情，但是任何人都不能代替法律作出判决，既然你要贯彻你的信念，那我也要坚持我的意志。
来吧！我接受你的挑战，看看谁能更早的找出真相。
……
一周前，毛利叔叔收到一封由剪报做成的匿名信件。
“下一个满月的夜晚，在月影岛上将会再次开始有影子消失，请你调查原因。麻生圭二。”
如果是以前，在温饱线上苦苦挣扎，经常好几个星期接不到一起委托的毛利叔叔必然会第一时间赶过去。但自从我帮他破了几起案件，使得叔叔在圈内拥有了一定的知名度，所以现在他可以挑选自己喜欢的案件去侦察。
原本接到匿名信的毛利叔叔也没当回事，他准备在周末去看冲野洋子演唱会，但一个神秘的电话改变了他的主意。
男人沙哑的嗓音从听筒里传出：“距离满月还有两天，手续费50万円已经全部都会进去了，你一定要来。”
“等……等一下，你到底是谁？”
“月影岛的麻生圭二。”
完，电话就挂了。
我曾经对叔叔过，应该在电话上装个来电显示器，这样可以查到电话的来源地，可是叔叔却宁可用这钱多买几瓶啤酒。
和他相比，我拥有许多阿笠博士特制的道具。
工欲善其事，必先利其器。难怪这么多年过去，我已经成为日本警察的救世主，而叔叔还只是个把案件引向迷宫的糊涂侦探。
此刻，我站在前往月影岛的船上，咸咸的海风吹打在脸上，对于一直住在大都市的我来，能和心爱的兰一起来这种乡下岛，十分欣喜。如果没有毛利叔叔当电灯泡就更完美了。
毛利叔叔了支烟，站在船头抱怨道：“真是的，明明就可以去赏花，为什么我名侦探毛利五郎非要到那种岛去不可！”
别人听叔叔的抱怨都会认为他是嫌路远而不愿意来，可是我却知道，叔叔是嫌弃委托人麻生圭二，这个名字一看就是个男人。
你没看出来吗？叔叔是在用赏花比喻看美女呢！
登上岛后，我们首先来到岛上办事处。从工作人员那里了解到，这次事件的委托人麻生圭二早在十二年前就死了。
那是十二年前的一个月圆的夜晚，著名钢琴家麻生圭二衣锦还乡，在村里的公民馆举行钢琴演奏会。演奏会后，他却突然杀死了自己的妻女，还放了火，在熊熊的火焰中好像是被什么缠住的样子，持续不断的弹着钢琴。就是贝多芬的钢琴奏鸣曲“月光”。
听到“死人”给自己寄信，毛利叔叔首先想到这是个恶作剧。
可我却不这么认为，没有人会平白无故用50万円来开这种玩笑，更何况信件上的邮戳也是来自影月岛。
侦探的直觉告诉我，这趟月影岛之行会很有趣，我潜藏在体内的侦探血液已经开始沸腾。
在我和兰的劝解下，毛利叔叔决定先去麻生圭二的死亡的公民馆看看。
路上，我们经过一家诊所，遇到一位叫做浅井成实的可爱姐姐，她是这座岛上的医生。
从她那里得知，目前月影岛上正在选举村长。三个候选人分别是渔民代表清水先生，现任村长黑岩先生，还有岛上最大的资产家川岛先生。而且今晚在公民馆，将举行前任村长龟山勇先生三周年忌辰的法事。
来到公民馆，我首先大致观察了一下地形，发现公民馆建在海边，后门面向大海。
在馆内转了一圈，我们来到一个空旷的房间，里面单独摆放着一架略显老旧的钢琴。
正当兰想触碰一下钢琴的时候。一个戴着眼镜的中年人走进来阻止道：“这是麻生先生死亡当天在演奏会上所弹的被诅咒的钢琴……”
原来不单单是麻生先生，就连前任村长龟山勇先生死前也是用这个钢琴弹奏“月光”。
真是可笑，我可是学过唯物主义，怎么会相信这种骗孩的东西！
接着我亲手弹了几下钢琴，发现钢琴的音色完全没有问题，感觉就像是近期有人专门对其进行过调试，一也看不出十几年没使用的样子。
中年男子自称是现任村长黑岩的秘书平田先生，他看到我弹钢琴的举动，变得十分紧张，“客气”的将我们请出房间，锁上房门，要求我们在玄关等待法事的结束。
在通往玄关的路上，我们又一次遇到成实医生，她作为前任村长尸体的检验者，特来拜祭。期间还给我们介绍与他同行的村长候选人——渔民代表清水先生。
法事漫长而又繁琐的进行着，我坐在玄关等待，并思考案情。
十二年前死者寄来的信件，被诅咒的钢琴。我预感会有大事要发生。
这时，公民馆内突然传来一阵钢琴演奏声，我虽然不擅长唱歌，但是却能听得出，这钢琴声是贝多芬的月光奏鸣曲！
我下意识的抬头仰望星空，看到一轮满月正高高挂在天际。
不好！我急速的往钢琴房跑去，却还是晚了一步。
三位村长候选人之一，岛上最大的资本家川岛先生就这样一动不动的趴在传中被诅咒的钢琴前。