第一阶段，卡卡西共培养了十种不同的神秘细胞；
第二阶段，才进入到真正的研究阶段。如果说培养期一共花了半年时间，那么研究期持续了整整一年。哪怕卡卡西的本体并不在，卡卡西的木遁分身们也会一丝不苟完成研究与记录！
第一个研究课题，神秘细胞自身到底是一种什么样的特性？
为此，卡卡西分别准了单独神秘细胞，以及各种不同特性催生快速成长神秘细胞。无一例外，这一细胞竟然具有极其强大吸收特性，更准确来说它会吞噬一切查克拉物质。强大的特性，吞噬比较缓慢；较弱的特性，吞噬极为快速。
是轮回眼能力，让自己的身体细胞同样具备了吞噬一切查克拉特性强大本体。还是这样身体，才孕育出了类似眼睛？
这个答案，卡卡西更亲睐后者。就算是再强大种族，也不可能天生就能开启六勾玉轮回眼。最好例子，长门拥有最为优秀的漩涡一族血统，成年之后也不过是勉强使用轮回眼基本能力。所以，是身体先一步影响到了眼睛的开启，而后眼睛才影响到身体进一步完善成长。
因此，卡卡西的研究计划在理论上是可行的。只要卡卡西让自己的身体来到最适合眼睛提升状态，眼睛自然会因为身体的改变发生改变！
第二个研究课题，一尾、三尾、九尾、十尾分别培育出来的神秘细胞，有什么差别？
单纯一尾细胞特性进行培育，需要消耗的一尾细胞特性非常之多，以至于卡卡西多次拜访了砂忍村我爱罗；
同样，单纯三尾细胞特性进行培育，需要消耗的三尾细胞特性不在少数。一段时间，卡卡西在水之国找到了三尾本体；
九尾就地取材，一如九尾强国其它尾兽太多，九尾细胞特性对前面两者产生了碾压效果；
星忍村的“星”最后还是待在卡卡西实验内，将单独十尾查克拉培育与前面三者进行比较。卡卡西发现了一个异常有趣现象，十尾查克拉特性竟然是最高度契合神秘细胞的那一个！
第三个研究课题，一尾、三尾、九尾，共同催生培育出来的神秘细胞。一尾、三尾、九尾，十尾共同催生培育出来的神秘细胞。二者，有什么差别？
首先，必须承认神秘尸体细胞本身，对尾兽查克拉有着非常好适应性，仿佛刻在细胞里烙印。哪怕是一尾、三尾、九尾，亦或是一尾、三尾、九尾、十尾这样的组合查克拉特性，最终都要被神秘细胞化为自己的生长养分；
其次，如今的十尾细胞特性就像是一个空壳，当它吸收到了一尾、三尾、九尾之... ...