就在此时，整个空间一阵动荡, 连原本守在这里的联盟军建立起来的全方位防线都有所松动。随后, 在那星球原本所在的位置, 暗物质导弹依旧还在发挥作用的中心处，空间却忽然一下子坍塌, 内缩形成一个黑洞。可随后那位置却奇异地像是忽然被一只大手撕开了般, 出现了一条幽黑的裂缝。
而后一只身上闪耀着明亮光彩的巨型鸟，从其中急射而出。它冲着人类张开它那巨大的鸟喙，呕出数十头体型较小而身带流光的各式生物。
可此时这些生物们，完全没有了当初躲藏在那星球背后的温和模样，它们漂浮在那黑黝黝的太空中，身上散发着明亮的光彩, 看起来是依旧是如此美丽。可现在它们一个个表情狰狞, 情绪暴躁，在空中无声嘶吼着。随后它们像是得到了什么命令似的，怒吼着冲向了曾对它们发起过攻击的舰队。
当这仅剩的几十头太空生物，冲向人类舰队所在位置时, 心知这种生物的防御力的卡彭特慌张地命令，“暗物质导弹准备，锁定目标，立刻开始攻击！”
可随后。下面就有人慌张禀报道：“将军，所有暗物质导弹之前已经全部用完了。”
事实上斯特兰奇送来的暗物质武器，本来就不够多。全力一炮射出之后就什么都不剩了。
可是眼前的这些似乎已经进入疯狂状态的宇宙生物，根本就不惧怕任何除暗物质武器以外的其他武器攻击。于是当敌人手头上再也没有什么东西能伤害到它们时, 它们疯狂冲入舰队方阵，张开嘴撞击撕咬着，整一场战斗几乎是一场一边倒的屠杀。
这场由人类自己挑起来的种族战争，爆发的速度快的得让人难以想象。当击败了萨利蒙，获得了自由的人类，在十几年后的今天之前，从不曾想过，在他们所统治的宇宙区域内已经出现了这样一股与他们旗鼓相当的对手。他们自大，盲目，过于自信，轻易开启了战端，却完全没有收拾战局的能力。
这场让人类自由联盟彻底崩溃的战争，由这一场小小的种族清理开始，最后扩大成为波及所有智慧生命的全面战争。直到战争结束，人类都不知道他们到底是打赢了这场仗，还是彻底失败了。
可是在战争初期，人类总以为自己是正义的，并且是必然胜利的。
当这场被清理的种族的余孽反扑，人类打了一场没想到过的败仗。整一支科莫德驻军守卫队全部被撕成碎片，而人类却拿这几十头小小的宇宙生物，完全没有办法。那几十头生物在泄愤般将所有的战舰吞入腹中之后，便大摇大摆地离开，消失在了人们的世界中。让对此既愤怒又恐惧的人类，却又显得毫无办法。
而这件事件的后续却依旧在不断的发酵。
首当其冲的便是当时阻止了暗武器运输的查普曼元帅。如果没有那一场反扑，那么查普曼的这一举动还不能能被解释为政见不同。可是到了如今，有不少人却在暗地里指责他为人类的叛徒。而联盟政府也便趁此机会想要剥夺查普曼元帅的军权，虽然此时联盟政府公信力也受到了一定的打击。
可是此时联盟议会中有很大一部分人，却不知为何忽然闭上了嘴。对于联盟主席乔迈吉的所有指令言听计从。而对于查普曼元帅的迫害。范围却越来越广。一道道指令下达，要求元帅交出指挥权，回到首都星接受审判。而在光网上原本由于重新回归那艘校船以及之后放出来的视频，让人们开始对于这件事情的起因产生了质疑。可这样的质疑，却被有心人掐灭在了摇篮中。那些刚刚升起的火苗立马熄灭，甚至都没有引起一丝波澜。
而就在此时人们还没有忘记那些让他们感到惊惧万分的一些生物，明明最后只剩下几十头，却依旧能不费吹灰之力地摧毁联盟军的一支强有力的舰队。这样的生物给人类带来了前所未有的恐惧。
甚至官网上开始出现许多言论，怀疑这样的生物，也许在许多人类还未涉及的无人性域中都有可能存在，只是他们从来没有关注过而已。于是人们开始要求彻查这些生物的存在。
乔麦吉为了获得更多人的支持，一边不断攻击着查普曼，一边开始救急军队彻查无人星。可是还没有等他们靠近那些区域，人们却发现他们早已被包围。那些他们从未关注过的无人星域中，无数散发着明亮光彩的生物们铺天盖地般冲向了人类的舰队。
完全没有做好心理准备的人类舰队，不得不快速撤出。而直到他们撤出到一定范围之外，那些可怕的生物才不断不再靠近他们。可是此时看着眼前那一眼无垠的身披流光的生物，这一次带军的那位将军，颤抖的双唇，根本不敢如卡彭特那般按下那个按钮。
没错，虽然这种生物看起来似乎对于暗物质武器依旧毫无抵抗能力。可是他的舰队搭载的暗物质导弹，根本就不够消灭这如许多的异星生命。而他也不是没有见过那种生物发狂之后的样子，仅仅只要几十头，就能撕碎他们这所有的舰队。
可眼前这些生物有多少头？几千？上万？甚至可能是几十万。而它们如此庞大的身躯，不惧怕除暗物质导弹之外攻击的任何攻击的强大防御能力，还有那让所有舰队都无可逃脱的速度。这大概是人类迄今为止遇到的除萨利蒙之外，最为强大而可怕的敌人。而它们的数量可比萨利蒙多得多得多了。
人类舰队不得不灰溜溜地离开了这片星域，而随后获知这个消息的联盟政府，却一片哗然。他们根本想不到，在他们不知不觉间，联盟内竟然已经有这样的一种生物，占领了联盟的大片无人星域，就活在他们眼皮子底下，不断发展壮大。
有人对此提出了不同意见，认为他们不该就此罢手。他们可以对那些即将濒临的生命生物建立保护区，保护它们的种族的延续。可是人类绝对不会允许在自己的领地范围内，出现一支能够威胁他们的种族。大多数人经历过与萨利蒙之间的战争，虽然现在这个敌人看起来如此强大，可他们依旧认为自己完全能够获得胜利，一切只是时间问题。
而乔麦吉当然也乐见其成。他以将发动对这种生物全面战争的理由，想要收回查普曼手中的军权。并且掌控了边境以及首都星区域内所有他能够抓在手里的军队。随后便大军对无人星域压境，携带了大量暗物质武器。
可谁知正当他们信心满满地将要对这种生物展开进攻之时，军中却出现了哗变。第一、三、四军团携带了大部分暗物质武器，从军中逃营了，顺便带走了大量战舰。
而失去了大部分暗物质导弹的联盟军，原本呈现对敌人包围姿态的他们，此时看起来却像是一群在强大捕食者面前瑟瑟发抖的小羔羊。即便头上顶着尖锐的羊角，可也依旧不是狼群的对手。于是这一次声势浩大的清理进攻，又再次灰溜溜地偃旗息鼓了。
而更糟糕的是，就在联盟内部由于查普曼元帅的反叛而一团乱的时候。由于两支第5军团驻军离开驻守地，终于让一直虎视眈眈的机械人抓住突破口。开始发起了他们的侵略战争。
机械人的军队却以科莫德驻军所在地为突破口，无数机器人大军在此处撕开了人类边防，此后长驱直入，直往首都星攻去。在此期间，机械人的军队几乎没有遇到过太过激烈的反抗，很快占领了大片人类星域。
幸而叛逃的查普曼元帅带着叛军，与入侵南方星域的机械人军队展开了大战，拖住了机械人继续入侵的步伐。
而由于叛军的牵制，驻守在首都星域的第二军团，也终于能喘口气，在节节败退之后，拿出了当时与萨利蒙对抗的坚定毅力，最终守住了首都星及后方区域。
可是在首都星到科莫德的那一大片星域内，所有星球却全部沦陷。
在那些被机械人攻占的星球上，人们人人心惶惶。这些机械人不知道发了什么疯，将所有的人类全部抓起来，随后便从脑后植入芯片。很快，那一颗颗星球上的人类，全都不再挣扎反抗。所有人像是行尸走肉般，开始像机械人一样服从主脑的命令。
他们撤掉了原本的一些基础社会机构，如学校、医院等。在他们看来人类不需要学习，只需要接受命令，并且在脑后接入口直接加载所需工作的执行程序。至于医院——报废的机械人有资格进行维修，至于人类，那只是一次性的使用工具而已。
他们有些被安排继续原本的工作，有些用于填补机械人内部工作空缺。另有一些却成为机械人的科研材料，还有一部分人甚至被圈禁起来，用于大量繁殖。
这些机械人用这样的方式彻底占领了这些星球，将人类变成了他们的子民与工具。
这一骇人听闻的惨状被一小部分逃脱的人类，传回未被攻占的星域之后，幸存星域的人们掀起了一波参军浪潮，誓要将这些星球重新夺回。可是这对于此时拼尽全力才能暂缓机械人进攻步伐的人类军来说，又谈何容易。
反而是原本一部分被不少无人星包围的某些住人星球，由于被围困在了异星生物的领地范围内，而异星生物们看起来似乎又对他们毫无兴趣。却使得这些星球以及上面的人类，反而完好地存活了下来。